phs000357:系统性硬化症全基因组关联研究
数据以病例对照设计组织,可用于系统性硬化症的全基因组关联分析,帮助识别与该疾病相关的遗传变异。本站分类:皮肤与结缔组织疾病/硬皮病

基本信息
资源简介
phs000357:系统性硬化症全基因组关联研究
phs000357 是一项围绕系统性硬化症开展的全基因组关联研究数据集,英文全称为 Genome-Wide Association Study in Systemic Sclerosis。该数据集在分类上归属于皮肤与结缔组织疾病下的硬皮病方向,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。根据源站描述,该研究属于 dbGaP 研究,采用病例对照(Case-Control)设计。数据以病例对照的方式组织,可用于系统性硬化症的全基因组关联分析,帮助识别与该疾病相关的遗传变异。该数据集的主题标签为 Case-Control,提示其核心设计特征在于通过比较病例组与对照组之间的遗传差异来探索疾病关联。整体而言,该数据集面向硬皮病尤其是系统性硬化症的遗传学研究需求,为相关遗传变异的识别与分析提供数据基础。
【数据集背景】
系统性硬化症是一种涉及皮肤与结缔组织的疾病,属于本站分类中的皮肤与结缔组织疾病 / 硬皮病方向。phs000357 即针对该疾病开展的全基因组关联研究,英文名称为 Genome-Wide Association Study in Systemic Sclerosis。该研究来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study,并明确其研究类型为 Case-Control。这意味着该数据集的设计初衷是通过病例与对照的对比,在全基因组范围内寻找与系统性硬化症相关的遗传信号。关于该研究的具体发起机构、研究周期、样本量、参与者招募背景等更详细的背景信息,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Case-Control,表明其数据组织方式围绕病例对照设计展开。依据源站描述,该研究为 dbGaP study (Case-Control),可用于系统性硬化症的全基因组关联分析,帮助识别与该疾病相关的遗传变异。因此,数据集的核心内容应服务于全基因组关联分析,即在全基因组范围内比较病例组与对照组,以发现与系统性硬化症相关的遗传变异。关于具体包含哪些类型的遗传数据、覆盖的变异位点数量、样本数量、表型字段、临床变量等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述其为 dbGaP study (Case-Control)。dbGaP 是 NCBI 下属的基因型与表型数据库,通常用于存储和分发与基因型-表型关联相关的研究数据。该数据集即通过该来源站发布,并采用病例对照设计。关于样本采集地点、采集时间、采集机构、伦理审批信息、参与者人群特征等具体采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于系统性硬化症的全基因组关联分析,可帮助识别与该疾病相关的遗传变异。由于其设计为病例对照研究,适合用于比较病例组与对照组之间的遗传差异,从而探索遗传因素与系统性硬化症之间的关联。其分类归属于皮肤与结缔组织疾病 / 硬皮病,因此也适合面向硬皮病相关遗传学研究的使用场景。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,例如是否可用于多疾病比较、药物基因组学、临床风险预测等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为 dbGaP study (Case-Control)。通常此类数据需通过来源站的相关机制进行访问与使用。关于该数据集的具体下载方式、访问权限、是否需要申请、使用协议、分析流程建议等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 dbGaP study,采用病例对照设计,主题标签为 Case-Control。关于该数据集的质量评估信息、样本质量控制指标、基因型 calling 质量、群体分层情况、统计效力、局限性说明等,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站描述为 dbGaP study (Case-Control)。关于该数据集的具体引用要求、许可条款、数据使用协议、致谢方式等,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000357
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control).
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