解析口腔扁平苔藓的单细胞系统性免疫图谱
该数据集是一个基于单细胞RNA测序技术的基因组学数据集,包含口腔扁平苔藓患者的单细胞基因表达和细胞多重标记数据,数据模态为单细胞转录组序列,主要用于研究口腔自身免疫性疾病的免疫细胞组成、基因表达谱及疾病机制,为免疫学研究和临床治疗提供数据支持。
基本信息
资源简介
该数据集是一个单细胞转录组数据集,旨在解析口腔扁平苔藓(一种常见的口腔自身免疫性疾病)患者体内的系统性免疫细胞图谱。数据包含通过10x Genomics平台制备的单细胞3'基因表达文库和细胞多重标记文库,采用Illumina平台进行双端测序,每个细胞包含16 bp的10x条形码和12 bp的独特分子标识符(UMI)。数据来源于患者样本,通过标准单细胞RNA测序流程构建,可用于研究口腔扁平苔藓的免疫细胞异质性、疾病相关基因表达变化及免疫调控机制,为自身免疫性疾病的诊断和治疗提供分子基础。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/dzszp4pbc7/1
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个单细胞转录组数据集,旨在解析口腔扁平苔藓(一种常见的口腔自身免疫性疾病)患者体内的系统性免疫细胞图谱。数据包含通过10x Genomics平台制备的单细胞3’'基因表达文库和细胞多重标记文库,采用Illumina平台进行双端测序,每个细胞包含16 bp的10x条形码和12 bp的独特分子标识符(UMI)。数据来源于患者样本,通过标准单细胞RNA测序流程构建,可用于研究口腔扁平苔藓的免疫细胞异质性、疾病相关基因表达变化及免疫调控机制,为自身免疫性疾病的诊断和治疗提供分子基础。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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