布里斯班双胞胎痣研究(BTNS)中全身痣数量的全基因组关联研究
该数据集是一个基于布里斯班双胞胎痣研究(BTNS)的全基因组关联研究(GWAS)数据集,包含3863名欧洲血统个体的全身痣数量计数和基因型数据,数据模态涉及临床计数表格和遗传变异信息,主要用于研究痣数量的遗传基础、探索皮肤表型与遗传变异之间的关联,并应用于皮肤癌风险预测和遗传流行病学分析。

基本信息
资源简介
布里斯班双胞胎痣研究(BTNS)中全身痣数量的全基因组关联研究
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-wide association study of full body nevus count in the Brisbane Twin Nevus Study (BTNS)》。项目资助方:Unravelling genetic influences on the human brain。源站首次发布:2023-05-10。
【数据内容】
源站原始描述:The project uses the Brisbane Twin Nevus Study (BTNS) (N=3863)) to compare nevus counts on different anatomical sites to assess which anatomical site serves as best proxy for counting nevi on the whole body.In the project, a GWAS of nevus count on the whole body and GWAS of nevus count on the outer arm are performed.Here is the GWAS of total nevus count. Sample: GWAS analysis only includes samples of European ancestry. total nevus count were counted by trained research nurse. Genotype: All genot…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 220.44 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.7918862。
【主题与分类】
主题标签:GWAS、Nevus count、SNP。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/records/7918862
使用许可:cc-by-4.0。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Zenodo 公开直链)
源站:https://zenodo.org/record/7918861
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数据说明
该数据集基于布里斯班双胞胎痣研究(BTNS),包含3863名欧洲血统个体的数据,旨在通过全基因组关联研究(GWAS)分析全身痣数量的遗传基础。数据内容包括染色体位置、SNP标识、等位基因频率、效应估计值、标准误和p值等遗传变异信息。数据来源于经过培训的研究护士计数的全身痣数量,并通过HapMap参考面板进行基因型插补,使用GEMMA方法校正了亲缘关系(如双胞胎和兄弟姐妹)以及年龄、性别、日晒等协变量。该数据集主要用于痣数量遗传学、皮肤表型与遗传变异关联的研究,可应用于皮肤癌风险预测和遗传流行病学分析。
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