全基因组关联研究识别与家羊睑内翻相关的SLC2A9和NLN基因区域
该数据集提供了针对家羊先天性睑内翻疾病的全基因组关联分析数据,主要包含998头不同品种羊的基因型数据(约5万个SNP标记),属于基因组学模态。研究通过统计分析识别出多个与疾病显著相关的基因区域,如SLC2A9和NLN附近区域,主要用于探索睑内翻的遗传机制、为家畜育种提供分子标记以及为人类相关眼睑疾病的比较医学研究提供参考。

基本信息
资源简介
全基因组关联研究识别与家羊睑内翻相关的SLC2A9和NLN基因区域
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Genome-Wide Association Identifies SLC2A9 and NLN Gene Regions as Associated with Entropion in Domestic Sheep》。配套论文《Genome-Wide Association Identifies SLC2A9 and NLN Gene Regions as Associated with Entropion in Domestic Sheep》发表于 PLOS ONE(2015),DOI:10.1371/journal.pone.0128909。源站首次发布:2015-06-22。
【数据内容】
源站原始描述:Entropion is an inward rolling of the eyelid allowing contact between the eyelashes and cornea that may lead to blindness if not corrected. Although many mammalian species, including humans and dogs, are afflicted by congenital entropion, no specific genes or gene regions related to development of entropion have been reported in any mammalian species to date. Entropion in domestic sheep is known to have a genetic component therefore, we used domestic sheep as a model system to identify genomic r…
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个,合计 43.59 MB。S1_Fig.pdf:application/pdf,189.34 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0128909。
【主题与分类】
源站学科分类:Uncategorised。主题标签:3CB、PIK、myo、2a、plink、snp、3h、gene regions、Rambouillet sheep genotyped、zc。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Uncategorised。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Genome_Wide_Association_Identifies_SLC2A9_and_NLN_Gene_Regions_as_Associated_with_Entropion_in_Domestic_Sheep/1456605
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:R. Mousel, Michelle; O. Reynolds, James; N. White, Stephen (2016). Genome-Wide Association Identifies SLC2A9 and NLN Gene Regions as Associated with Entropion in Domestic Sheep. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一项关于家羊先天性睑内翻的全基因组关联研究(GWAS)数据。睑内翻是一种眼睑向内卷曲的疾病,可导致睫毛与角膜接触,若不矫正可能致盲。数据集包含来自998头哥伦比亚羊、波利帕羊和兰布依埃羊的基因型数据,使用约50,000个单核苷酸多态性(SNP)标记进行基因分型。研究通过逻辑回归分析,在多种遗传模型下识别出与睑内翻显著相关的基因组区域,包括SLC2A9和NLN基因附近的区域,以及PIK3CB、KCNB1等多个提示性关联位点。该研究首次在哺乳动物中报告了与先天性睑内翻相关的特定基因区域,为理解该疾病的遗传基础、开发用于标记辅助选择的遗传标记以及比较医学研究提供了重要资源。
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