弥漫性大B细胞淋巴瘤虚拟组织数据集

该数据集包含弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的批量RNA测序和单细胞RNA测序表达数据,以及通过TissueResolver算法生成的虚拟组织数据,整合了Schmitz等人(2018)的批量数据和Roider等人(2020)、Steen等人(2021)的单细胞数据,经过特征选择和归一化处理,用于肿瘤微环境分析、细胞类型去卷积和基因表达模拟等生物医学研究方向,支持在单细胞水平解析淋巴瘤的分子特征。

Zenodo
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2024-01-25 更新
淋巴瘤单细胞转录组RNA-seq数据整合
创建时间2023-11-23
更新时间2024-01-25
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10139154

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资源简介

该数据集是一个生物信息学数据集,用于通过虚拟组织技术研究弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)。数据集包含DLBCL的批量RNA测序(bulk RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)表达数据,以及利用TissueResolver算法生成的虚拟组织数据。具体而言,数据整合了Schmitz等人(2018)的批量RNA-seq数据,以及Roider等人(2020)和Steen等人(2021)的单细胞RNA-seq数据,经过特征选择和TMM归一化处理后,生成了虚拟组织表达谱,同时计算了细胞类型特异性基因表达值。该数据集主要用于肿瘤微环境分析、细胞类型去卷积、基因表达模拟等生物医学研究方向,支持在单细胞水平上模拟和解析淋巴瘤组织的分子特征。

提供机构:Zenodo

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影像Virtual Tissues of DLBCL lymphomas