HLA变异是脓疱性皮肤病新遗传风险因素数据集
该数据集来自 data.mendeley.com，聚焦脓疱性皮肤病（以脓疱型银屑病 PP 为原型）的 HLA 变异遗传风险研究
基本信息
资源简介
HLA变异是脓疱性皮肤病新遗传风险因素数据集
该数据集英文名为 Dataset for HLA variants are novel genetic risk factor of pustular skin diseases，来自 data.mendeley.com，本站归类为皮肤与结缔组织疾病下的遗传性皮肤病。数据集聚焦脓疱性皮肤病（以脓疱型银屑病 PP 为原型）的 HLA 变异遗传风险研究，共包含 6 个文件，合计 21.37 MB，于 2023 年 1 月 4 日发布，版本为 v2，DOI 为 10.17632/cbvw68rd9k.2。数据文件涵盖 HLA 分型表格、元数据表格、VCF 变异文件、VEP 注释文本及代码文本等，适合围绕 HLA 变异与脓疱性皮肤病遗传风险开展分析。
【数据集背景】
脓疱性皮肤病是一类免疫介导的疾病，以脓疱型银屑病（PP）为原型，其特征是表皮层中性粒细胞聚集导致多发脓疱。该数据集围绕此类疾病的 HLA 变异遗传风险展开，主题定位于 HLA 变异作为脓疱性皮肤病的新型遗传风险因素。
【数据内容】
数据集共包含 6 个文件，文件样例包括 1_HLA_typing.csv、2_metadata.csv、3_BIALLELIC.VCF、4_VEP_annotation.txt、5_Code_xHLA.txt 以及 Readme.txt，合计 21.37 MB。从文件构成看，内容涉及 HLA 分型结果、样本元数据、双等位基因 VCF 变异记录、VEP 注释信息以及相关代码文本，并配有说明文件。各文件的具体字段、样本数量与变异位点数量源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 data.mendeley.com，DOI 为 10.17632/cbvw68rd9k.2，版本为 v2，发布时间为 2023 年 1 月 4 日。源站描述指出，脓疱性皮肤病是以脓疱型银屑病为原型的免疫介导疾病，特征为表皮层中性粒细胞聚集引起的多发脓疱。除上述来源与描述信息外，样本采集地点、采集时间、纳入排除标准等源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕脓疱性皮肤病（尤其是脓疱型银屑病）的 HLA 变异遗传风险研究，可用于 HLA 分型数据的整理与核对、变异位点的注释信息查阅，以及结合元数据开展样本层面的遗传关联分析。由于包含 VCF 与 VEP 注释文件，也适合用于变异筛选与功能注释相关的分析流程。具体分析结论与适用范围源站未提供。
【使用方法】
使用时可下载全部 6 个数据文件，合计 21.37 MB，按文件格式分别读取：CSV 表格、VCF 文件与纯文本文件。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。Readme.txt 可作为文件说明的参考。各文件之间的对应关系与具体读取参数源站未提供。
【质量与限制】
数据集提供了版本号 v2 与 DOI，便于版本追溯与引用。文件数量为 6 个，体量较小，便于快速核对。关于数据完整性、缺失值情况、质控标准与已知偏差，源站未提供。
【引用与许可】
引用时应使用该数据集的 DOI：10.17632/cbvw68rd9k.2，并注明版本 v2 与来源站 data.mendeley.com。具体许可条款与使用限制源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/cbvw68rd9k
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 21.4 MB。
数据说明
Apiwat Sangphukieo (2023). Dataset for HLA variants are novel genetic risk factor of pustular skin diseases [Dataset]. http://doi.org/10.17632/cbvw68rd9k.2
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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