一例中国患者中导致脊柱后侧凸埃勒斯-当洛斯综合征的新型PLOD1基因突变

该数据集包含一例中国脊柱后侧凸埃勒斯-当洛斯综合征(kEDS)患者的病例数据,涉及临床、影像和基因等多模态信息,具体包括患者的临床病史、体格检查、X光影像(显示脊柱侧凸和骨质疏松)以及PLOD1基因突变分析结果,通过发现新型纯合错义突变(c.1697 G>A, p.C566Y)首次报道了中国人群中的kEDS-PLOD1亚型,主要用于遗传病机制研究、临床诊断辅助和生物信息学分析,为罕见结缔组织疾病的基因型-表型关联提供关键参考。

Mendeley Data
2024-03-27 更新
浏览 58
遗传性结缔组织病基因突变致病性分析
A Novel PLOD1 Gene Mutation causing Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos Syndrome in a Chinese patient

基本信息

大小
0.003131531 GB
创建/更新时间
2024-03-27
版本
v1

资源简介

一例中国患者中导致脊柱后侧凸埃勒斯-当洛斯综合征的新型PLOD1基因突变

【数据集背景】

本数据集源站标题为《A Novel PLOD1 Gene Mutation causing Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos Syndrome in Chinese patient》。源站首次发布:2020-10-15。

【数据内容】

源站原始描述:Kyphoscoliotic Ehlers-Danlos syndrome (kEDS) is a rare autosomal recessive connective tissue disorder characterized by progressive kyphoscoliosis, congenital muscular hypotonia, marked joint hypermobility, and severe skin hyperextensibility and fragility. Deficiency of lysyl hydroxylase 1 (LH1) due to mutations of PLOD1 (procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1) gene has been identified as the pathogenic cause of kEDS (kEDS-PLOD1). Up to now, kEDS-PLOD1 has not been reported among Chin…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 3.13 MB。数据集 DOI:10.17632/r8kmp2tkv9.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/r8kmp2tkv9

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集聚焦于脊柱后侧凸埃勒斯-当洛斯综合征(kEDS),这是一种罕见的常染色体隐性遗传结缔组织病,特征包括进行性脊柱后侧凸、先天性肌张力低下、显著关节过度活动以及严重皮肤过度伸展和脆弱。数据集报道了一例17岁中国男性患者的病例,通过基因分析发现了一种新型PLOD1基因纯合错义突变(c.1697 G>A, p.C566Y),导致赖氨酰羟化酶1(LH1)缺陷,从而确诊为kEDS-PLOD1亚型。数据内容包括患者的临床病史、体格检查、影像学结果(X光显示严重脊柱侧凸和骨质疏松)、实验室检查以及遗传分析结果,并提供了突变致病性预测工具(如Polyphen-2、SIFT和Mutation Taster)的评估。该数据集首次报告了中国人群中的kEDS-PLOD1病例,为研究该疾病的基因突变谱、临床表型及诊断提供了重要数据,适用于遗传病学、临床医学和生物信息学领域的研究。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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