基于高多重质谱流式细胞术的皮肌炎皮肤免疫表型识别
本数据集为基于质谱流式细胞成像技术获取的皮肌炎皮肤单细胞免疫表型数据,包含单核-巨噬细胞、T细胞、树突状细胞等多种免疫细胞的亚群分布、活化标志物及细胞因子表达信息,并关联了临床疾病评分与瘙痒指标;该数据集主要用于研究自身免疫性皮肤病(如皮肌炎)的免疫微环境特征、炎症通路调控机制,为疾病机制解析和靶向治疗策略开发提供细胞水平的数据支持。

基本信息
资源简介
基于高多重质谱流式细胞术的皮肌炎皮肤免疫表型识别
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Highly Multiplexed Mass Cytometry Identifies the Immunophenotype in the Skin of Dermatomyositis》。源站首次发布:2021-05-07。
【数据内容】
源站原始描述:Dermatomyositis (DM) is a rare, systemic autoimmune disease that most frequently affects the skin, muscles, and lungs. The inflammatory infiltrate in the skin has not been fully characterized, and, in this study, we took a single-cell, unbiased approach using imaging mass cytometry. Substantial monocyte‒macrophage diversity was observed, with the CD14+ population correlating positively with Cutaneous Dermatomyositis Disease Area and Severity Index scores (P = 0.031). The T-cell compartment revea…
【数据结构与技术规格】
文件数 15 个,合计 2.11 GB。数据集 DOI:10.17632/8pr3btv5t4.3。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/8pr3btv5t4
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/8pr3btv5t4
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- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集利用质谱流式细胞成像技术,对皮肌炎(一种罕见的系统性自身免疫性疾病)患者皮肤样本进行单细胞水平的免疫表型分析。数据集包含通过高多重质谱流式细胞术获取的皮肤组织单细胞数据,详细表征了免疫细胞(如单核-巨噬细胞、T细胞、树突状细胞等)的亚群分布、活化状态及细胞因子表达情况,并关联了临床评分指标(如皮肤皮肌炎疾病面积和严重程度指数)。数据来源于患者皮肤样本的实验分析,旨在揭示皮肌炎的皮肤免疫微环境特征、关键炎症通路及细胞因子调控机制,为自身免疫性皮肤病的病理机制研究和靶向治疗开发提供重要依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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