跨组织单细胞基质细胞图谱识别四种慢性炎症疾病共享的病理性成纤维细胞表型 [RNA-Seq]
该数据集为 RNA-Seq 数据,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站归类于皮肤与结缔组织疾病下的皮炎
![Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/140570.jpg)
基本信息
资源简介
跨组织单细胞基质细胞图谱识别四种慢性炎症疾病共享的病理性成纤维细胞表型 [RNA-Seq]
该数据集英文名为 Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases [RNA-Seq],是一项以 RNA-Seq 为技术基础的数据资源,主题标签为 Genomics,在来源站 omicsdi.org 上登记,本站将其归类于皮肤与结缔组织疾病下的皮炎类别。从名称可以看出,该数据集围绕跨组织的单细胞基质细胞图谱展开,旨在识别四种慢性炎症性疾病中共有的病理性成纤维细胞表型。数据以 RNA-Seq 形式组织,属于基因组学范畴,可为研究慢性炎症背景下基质细胞与成纤维细胞的异质性提供数据支撑。以下依据可获得的信息,对该数据集的相关方面作分段说明。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究主题为跨组织、单细胞层面的基质细胞图谱构建,关注四种慢性炎症性疾病中是否存在共有的病理性成纤维细胞表型。这一主题将慢性炎症性疾病的基质细胞研究置于跨组织的比较框架之下,强调不同疾病之间可能共享的成纤维细胞病理状态。数据集名称中明确标注了 RNA-Seq,表明其数据产生方式属于转录组测序范畴。本站将其归入皮肤与结缔组织疾病下的皮炎分类,说明该资源在站内分类体系中与皮肤及结缔组织相关的炎症性疾病方向相关联。关于研究的具体背景细节、所涉四种疾病的具体名称以及样本组织类型,源站未提供。
【数据内容】
该数据集为 RNA-Seq 数据,主题标签为 Genomics。从名称可知其内容与单细胞基质细胞图谱相关,涉及成纤维细胞表型的识别与比较。数据的具体组成,包括样本数量、细胞数量、测序读长、表达矩阵形式、注释文件种类等,源站未提供。数据是否包含原始测序数据、处理后表达矩阵或二者兼有,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,并在本站登记展示。源站描述与数据集英文名一致,均为 Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases [RNA-Seq]。关于样本采集的组织来源、供体信息、伦理审批、测序平台与试剂等采集细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与数据类型,该数据集适用于与慢性炎症性疾病基质细胞、成纤维细胞表型异质性、跨组织比较相关的转录组分析场景,也可用于基因组学方向的数据整合与方法验证。由于本站分类将其归入皮肤与结缔组织疾病下的皮炎,该资源亦可作为该疾病方向研究的参考数据。具体适用的分析任务类型与疾病范围,源站未提供。
【使用方法】
该数据集的使用方式、下载途径、文件组织格式、预处理流程与配套分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的质量评估信息、数据完整性说明、批次效应处理情况以及使用中的已知限制,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA770554
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Cross-tissue, single-cell stromal atlas identifies shared pathological fibroblast phenotypes in four chronic inflammatory diseases [RNA-Seq]
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