Hinchcliff 165 微阵列数据集

该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,可用于结缔组织疾病相关的基因表达分析研究(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL64809606
GSE59787: Hinchcliff 165 microarray dataset

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

Hinchcliff 165 微阵列数据集

GSE59787: Hinchcliff 165 microarray dataset 是一个来源于 NCBI 的基因表达谱数据集,标题为 Hinchcliff 165 microarray dataset,在本站归类于皮肤与结缔组织疾病 / 结缔组织疾病方向。该数据集属于 SuperSeries 类型,其源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE59787_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Expression profiling by array、GPL6480 以及 9606。整体而言,该数据集可用于结缔组织疾病相关的基因表达分析研究,为相关领域的表达谱探索提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,标题为 Hinchcliff 165 microarray dataset,作者为 Tammara、Wood,发布时间为 Jul 25 201。数据集在本站被归类为皮肤与结缔组织疾病 / 结缔组织疾病,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6480 和 9606。从源站描述来看,该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,说明其结构上是一个整合多个子系列的高层级数据集。此类 SuperSeries 通常用于将同一研究背景下多个相关的表达谱子系列组织在一起,便于统一检索和引用。该数据集的侧写线索指出,它可用于结缔组织疾病相关的基因表达分析研究。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE59787_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,通常包含系列矩阵信息,可用于读取样本层面的表达数据及相关注释。主题标签中的 Expression profiling by array 表明数据基于微阵列表达谱技术,GPL6480 为平台标识,9606 为物种标识。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未进一步提供样本数量、基因数量、分组信息或具体表达值等细节。除上述文件信息外,数据内容的具体字段、编码方式和注释结构在现有信息中未作说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 Hinchcliff 165 microarray dataset,作者为 Tammara、Wood,发布时间为 Jul 25 201。数据集英文名为 GSE59787: Hinchcliff 165 microarray dataset。其主题标签显示数据通过微阵列进行表达谱分析,涉及平台 GPL6480 和物种标识 9606。源站描述指出该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成。关于具体的样本采集地点、采集时间、实验设计、伦理审批信息以及受试者来源等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于结缔组织疾病相关的基因表达分析研究。结合其分类为皮肤与结缔组织疾病 / 结缔组织疾病,以及主题标签中的表达谱分析和平台信息,该数据适合用于探索结缔组织疾病背景下基因表达模式的分析工作。由于其为 SuperSeries,可能适合用于整合多个 SubSeries 的联合分析场景。具体的研究用途、疾病亚型、比较分组和生物学假设,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可下载数据文件 GSE59787_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,需按相应格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码差异导致的分析错误。关于具体的读取命令、软件包、预处理步骤和标准化方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE59787_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,未提供样本量、数据完整性、缺失值情况、批次效应或质量控制指标等信息。发布时间为 Jul 25 201,作者为 Tammara、Wood。关于数据质量评估、技术验证、重复性以及潜在偏倚等,源站未提供。使用时应注意仅依据可获取的文件和注释进行判断,并在小样本核对后再批量接入。

【引用与许可】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,标题为 Hinchcliff 165 microarray dataset,作者为 Tammara、Wood,发布时间为 Jul 25 201。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制以及再分发条件,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考来源站点的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE59787

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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