尿毒症钙化防御皮肤微环境中TYMP-IL-6-TF信号通路的激活与靶向性数据集

该数据集包含尿毒症钙化防御患者皮肤微环境的RNA-seq基因表达数据(包括原始计数和标准化计数),属于多模态生物医学数据,整合了转录组测序结果与配套的分析代码;主要用于研究TYMP-IL-6-TF信号通路在疾病皮肤中的激活机制与靶向治疗潜力,支持生物信息学分析、疾病机制探索及潜在生物标志物发现等研究方向。

Boston Medical CenterBoston Medical Center
Zenodo
2025-03-23 更新
浏览 31
尿毒症性钙化防御机制皮肤微环境多组学分析
ACTIVATION AND TARGETABILITY OF TYMP-IL-6-TF SIGNALING IN THE SKIN MICROENVIRONMENT IN UREMIC CALCIPHYLAXIS

基本信息

大小
0.009987965 GB
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2025-03-23

资源简介

尿毒症钙化防御皮肤微环境中TYMP-IL-6-TF信号通路的激活与靶向性数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《ACTIVATION AND TARGETABILITY OF TYMP-IL-6-TF SIGNALING IN THE SKIN MICROENVIRONMENT IN UREMIC CALCIPHYLAXIS》。源站首次发布:2025-03-03。

【数据内容】

源站原始描述:This repository contains merged RNA-seq raw count data and count data after normalization described in the papaer with Rstudio and Python3 code to re-create the Olink protein abundancy results, differential gene exression results, ligand-receptor analysis results (in DEG_LR.zip) and ROI-ROI communication probability results (in spOTsc_remake.zip) and make plots shown in the paper

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 9.99 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.14962510。

【主题与分类】

主题标签:Calciphylaxis。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/14962510

使用许可:cc-by-4.0。

规范引用:Science Translational Medicine

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-03-23,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.14962510

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数据说明

该数据集聚焦于尿毒症钙化防御(一种与慢性肾病相关的严重血管钙化疾病)的皮肤微环境研究,主要包含合并后的RNA-seq原始计数数据及标准化后的基因表达数据。数据来源于相关研究论文,并附有用于复现分析结果的RStudio和Python3代码,可重新生成Olink蛋白丰度结果、差异基因表达分析结果、配体-受体互作分析结果(位于DEG_LR.zip)以及空间区域间通讯概率结果(位于spOTsc_remake.zip)。该数据集主要用于探究TYMP-IL-6-TF信号通路在疾病皮肤微环境中的激活状态与潜在靶向治疗价值,支持生物信息学、皮肤病学、肾脏病学及肿瘤微环境等领域的研究。

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