大疱性类天疱疮单细胞RNA测序数据集

该数据集是一个包含33个样本的单细胞转录组测序数据集,数据模态为单细胞RNA测序(scRNA-seq)的基因表达矩阵。它专门针对大疱性类天疱疮(BP),涵盖了患者的皮损组织、水疱、外周血单个核细胞以及健康对照的皮肤和血液样本,主要用于研究这种自身免疫性皮肤病的免疫微环境、细胞异质性以及免疫与基质细胞间的相互作用机制。

Zenodo
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2024-07-16 更新
创建时间2024-04-26
更新时间2024-07-16
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10924853

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资源简介

该数据集是一个针对大疱性类天疱疮(Bullous Pemphigoid,BP)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集。它包含33个样本的稀疏计数表,数据格式为10X Genomics标准格式(barcodes.tsv.gz、features.tsv.gz、matrix.mtx.gz)。具体样本包括:5例BP患者的皮损组织、8例健康供体的正常皮肤、8例BP患者的外周血单个核细胞(PBMC)、8例健康供体的PBMC,以及4例BP患者的水疱样本。数据来源于相关研究(Nat Commun 15, 5949 (2024)),旨在通过单细胞转录组学分析揭示BP这种2型炎症性疾病中的免疫-基质细胞相互作用。该数据集主要用于免疫学、皮肤病学、自身免疫性疾病机制以及单细胞组学分析等领域的研究。

提供机构:Zenodo

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影像The single cell RNA sequencing of Bullous Pemphigoid