来自两项研究的基底细胞癌样本（过滤后癌细胞）
该数据集包含来自两项独立研究的11个基底细胞癌样本的单细胞RNA测序数据，以预处理后的Seurat对象格式存储，仅保留了通过患者混合、特征评分和拷贝数变异分析筛选出的恶性细胞亚群，主要用于基底细胞癌的肿瘤异质性、癌细胞转录组特征及肿瘤微环境等相关研究。
基本信息
资源简介
来自两项研究的基底细胞癌样本（过滤后癌细胞）
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Basal cell carcinoma samples from two studies (filtered cancer cells)》。源站首次发布：2024-07-17。
【数据内容】
源站原始描述：This dataset, stored as a Seurat object in .rds format, contains pre-processed scRNA-seq data for 11 basal cell carcinoma (BCC) samples from 2 studies (Yerly et al. Nat Comms (2024) and Ganier et al. PNAS (2024)). This dataset only contains the malignant subset of cells from the original samples, which were subset by a combination of patient mixing, signature scoring and CNV alteration patterns, as described in Yerly et al. biorXiv (2024)
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 205.79 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.26318794.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Cancer cell biology、Genomics and transcriptomics。主题标签：Basal Cell. Carcinoma、scRNA-seq、cancer cells。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Cancer cell biology、Genomics and transcriptomics。
【获取与许可】
源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/Basal_cell_carcinoma_samples_from_two_studies_filtered_cancer_cells_/26318794
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Andreatta, Massimo; Yerly, Laura; Carmona, Santiago (2024). Basal cell carcinoma samples from two studies (filtered cancer cells). figshare. Dataset
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集以Seurat对象的.rds格式存储，包含来自两项研究（Yerly等人发表于《自然·通讯》2024年和Ganier等人发表于《美国国家科学院院刊》2024年）的11个基底细胞癌（BCC）样本的预处理单细胞RNA测序数据。数据集仅包含原始样本中的恶性细胞亚群，这些细胞是通过患者混合、特征评分和拷贝数变异模式分析等方法筛选得到的，具体方法见Yerly等人于bioRxiv预印平台（2024年）的描述。该数据集主要用于基底细胞癌的肿瘤异质性、癌细胞转录组特征及肿瘤微环境等方向的研究。
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