高纤维饮食小鼠甲醇提取物蛋白质组数据

该数据集来自 omicsdi.org,主题标签为 Proteomics,比较高纤维饮食小鼠与对照小鼠的甲醇提取物,采用 q exactive hf 与 28 min 方法采集数据

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
high fiber diet mice methanol extracts

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

高纤维饮食小鼠甲醇提取物蛋白质组数据

该数据集名为 high fiber diet mice methanol extracts,收录于 omicsdi.org,归类于皮肤与结缔组织疾病下的特应性皮炎(湿疹)方向,主题标签为 Proteomics。其核心内容是比较高纤维饮食小鼠与对照小鼠的甲醇提取物,采用 q exactive hf 质谱平台与 28 min 方法进行数据采集。该数据集面向蛋白质组学研究,可用于观察高纤维饮食干预下小鼠样本中蛋白质层面的变化,为理解饮食因素与皮肤及结缔组织疾病之间的潜在联系提供数据基础。整体而言,该数据集以小鼠为研究对象,以甲醇提取为样本处理方式,以高分辨质谱为检测手段,围绕高纤维饮食与对照条件之间的差异展开,适合作为蛋白质组学差异分析、饮食干预机制探索以及相关疾病背景研究的参考数据资源。

【数据集背景】

该数据集的主题标签为 Proteomics,所属分类为皮肤与结缔组织疾病 / 特应性皮炎(湿疹)。从来源站 omicsdi.org 的描述可知,该数据集关注的是高纤维饮食小鼠与对照小鼠之间的比较,具体为甲醇提取物的蛋白质组学分析。高纤维饮食作为一种饮食干预因素,可能影响机体的代谢与蛋白质表达状态,而将其与特应性皮炎(湿疹)这一皮肤与结缔组织疾病方向相关联,提示该数据集可能用于探索饮食结构变化在皮肤相关疾病研究中的潜在作用。源站未提供该数据集的具体研究背景、实验假设、动物模型构建细节以及高纤维饮食的具体配方信息。

【数据内容】

该数据集的核心内容是比较高纤维饮食小鼠与对照小鼠的甲醇提取物。样本类型为小鼠来源的甲醇提取物,比较分组包括高纤维饮食组与对照组。数据采集采用 q exactive hf 质谱平台,并使用 28 min 方法。主题标签为 Proteomics,表明数据属于蛋白质组学范畴。源站未提供样本数量、生物学重复数、蛋白质鉴定数量、差异表达蛋白列表、定量结果以及原始数据文件的具体格式与大小等信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,其采集方式为比较高纤维饮食与对照小鼠的甲醇提取物,使用 q exactive hf 质谱仪,并采用 28 min 方法。q exactive hf 是一种高分辨质谱平台,常用于蛋白质组学分析;28 min 方法通常指液相色谱梯度或质谱采集方法的总运行时间。该数据集的来源站为 omicsdi.org,属于蛋白质组学数据资源。源站未提供具体的样本制备流程、色谱条件、质谱参数、数据采集软件版本以及原始数据存储位置等详细信息。

【适用场景】

基于该数据集的主题标签与来源描述,其适用场景主要包括蛋白质组学差异分析、高纤维饮食干预与对照条件之间的比较研究,以及皮肤与结缔组织疾病 / 特应性皮炎(湿疹)相关背景下的饮食因素探索。研究人员可利用该数据集了解高纤维饮食小鼠与对照小鼠在甲醇提取物中的蛋白质组学差异,进而为后续机制研究、生物标志物筛选或饮食干预策略提供参考。由于该数据集归类于特应性皮炎(湿疹)方向,也可能适用于皮肤疾病与饮食关联的初步数据挖掘。源站未提供该数据集在具体疾病机制、临床转化或药物开发中的明确应用案例。

【使用方法】

该数据集的使用需结合其蛋白质组学数据属性。用户可通过 omicsdi.org 获取该数据集,并依据 q exactive hf 平台与 28 min 方法所采集的数据进行蛋白质鉴定与定量分析。比较高纤维饮食组与对照组时,可采用常见的蛋白质组学差异分析流程,包括数据预处理、归一化、差异蛋白筛选与功能注释等。由于主题标签为 Proteomics,用户应具备蛋白质组学数据处理的基本知识。源站未提供具体的数据下载格式、分析软件推荐、参数设置指南以及配套的代码或流程说明。

【质量与限制】

该数据集采用 q exactive hf 质谱平台与 28 min 方法,具备高分辨质谱数据的基本特征。其比较设计为高纤维饮食小鼠与对照小鼠的甲醇提取物,主题标签为 Proteomics,归类于皮肤与结缔组织疾病 / 特应性皮炎(湿疹)。然而,源站未提供样本量、重复数、数据完整性、缺失值比例、鉴定置信度、定量准确性以及批次效应等质量评估信息。此外,源站未提供该数据集的具体实验设计细节、统计分析方法与结果验证情况。因此,在使用该数据集时,应关注其来源描述中未覆盖的质量维度,并结合自身研究目的谨慎解读。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及版权信息。用户在使用该数据集时,应直接访问 omicsdi.org 查看相关条目以获取最新的引用与许可要求。源站未提供具体的 DOI、数据集编号或作者信息。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000086890

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

comparison between high fiber diet and ctrl mice methanol extraction, q exactive hf, 28 min method

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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