人类皮肤样本转录组研究:日光性角化病两个风险类别鉴定

该数据集来自 NCBI GEO,标题为人类皮肤样本转录组研究,旨在通过基因表达谱分析鉴定日光性角化病的两个风险类别。数据集包含 1 个文件,样例为 GSE207744_series_matrix.txt.gz,属于皮肤与结缔组织疾病分类下的日光性角化病主题

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL211859606
GSE207744: Transcriptomic study on human skin samples: identification of actinic keratoses two risk classes.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

人类皮肤样本转录组研究:日光性角化病两个风险类别鉴定

GSE207744 是一项来自 NCBI GEO 的人类皮肤样本转录组研究数据集,主题为通过基因表达谱分析鉴定日光性角化病的两个风险类别。该数据集归属于皮肤与结缔组织疾病分类下的日光性角化病主题,由 Hélène、Dubois-Pot-Schneider 提交,发布时间为 Jul 08 202。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE207744_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。其主题标签涉及表达谱芯片分析、GPL21185 平台以及物种编号 9606(即人类)。整体而言,该数据集面向日光性角化病的分子分型研究,为探索该疾病的两种风险类别提供了基因表达层面的数据基础。

【数据集背景】

日光性角化病是一种与长期日光暴露相关的皮肤病变,在皮肤与结缔组织疾病研究中受到关注。该数据集源站标题为“Transcriptomic study on human skin samples: identification of actinic keratoses two risk classes”,即“人类皮肤样本转录组研究:鉴定日光性角化病的两个风险类别”。源站描述指出,基因表达谱分析使得识别日光性角化病的 2 个类别成为可能。这表明该研究的核心目标是通过转录组层面的表达特征,区分日光性角化病样本中的不同风险类别,为后续的疾病风险评估与机制研究提供依据。

【数据内容】

该数据集的文件数量为 1,样例文件名为 GSE207744_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。从文件命名来看,其内容为系列矩阵形式的数据文件,通常用于承载样本层面的基因表达信息。主题标签中包含“Expression profiling by array”,说明数据来源于芯片表达谱分析;标签中的 GPL21185 指向所使用的芯片平台编号,9606 则对应人类物种。数据集的具体样本数量、基因数量、分组标注及临床信息等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。研究材料为人类皮肤样本,研究类型为转录组表达谱分析。数据由 Hélène、Dubois-Pot-Schneider 提交,发布时间为 Jul 08 202。关于样本采集的具体部位、采集流程、伦理审批信息以及实验操作细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与数据类型,该数据集适用于日光性角化病分子分型相关的研究场景,例如比较不同风险类别之间的基因表达差异、探索与风险分层相关的表达特征,以及作为皮肤与结缔组织疾病转录组研究的参考数据。由于数据以芯片表达谱形式组织,也可用于方法学层面的表达数据读取、预处理与分类分析练习。需要说明的是,上述适用方向依据数据主题与类型的一般用途组织,数据集本身是否附带特定分析结论,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE207744_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行解压与读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认无误后再批量接入完整数据,以避免因格式或编码问题导致解析错误。关于该系列矩阵文件的具体字段含义、是否需要额外的平台注释文件以及推荐的分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本构成信息有限,源站未提供样本量、分组均衡性、数据完整性及质控指标等细节。由于缺少这些信息,使用者在开展分析前应自行核查数据质量与适用性。此外,该数据集基于芯片表达谱平台,其结果解释需结合平台特性,具体平台信息可参考 GPL21185,但平台注释细节源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Hélène、Dubois-Pot-Schneider,来源为 NCBI GEO。关于该数据集的具体引用格式、许可条款及使用限制,源站未提供,使用者在引用与再分发前应查阅源站页面获取准确信息。

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使用方式

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207744

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gene expression profile analysis allowed to identify 2 classes of AK.

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