用于连续谱量化肌成纤维细胞活化的数据集

数据由作者Hillsley, Alexander发布,机构为Texas Data Repository,发布时间为2022年,主题涉及医学、健康与生命科学及显微镜检查

Texas Data RepositoryTexas Data Repository
dataverse
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医学影像图像分割Medicine, Health and Life SciencesMicroscopy
Data for: A strategy to quantify myofibroblast activation on a continuous spectrum

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

用于连续谱量化肌成纤维细胞活化的数据集

Data for: A strategy to quantify myofibroblast activation on a continuous spectrum 是一个面向医学、健康与生命科学以及显微镜检查研究的数据集,由作者 Hillsley, Alexander 发布,发布机构为 Texas Data Repository,发布时间为 2022 年。该数据集收录了用于相关手稿研究的细胞四通道图像,涵盖 F-Actin、alpha smooth muscle actin、DAPI 与 Phase-contrast 四种成像通道,来源站为 doi.org。从分类上看,该数据集归属于皮肤与结缔组织疾病下的日光性角化病方向,可为相关细胞形态与标记物观察提供图像层面的数据基础。

【数据集背景】

该数据集伴随一项关于在连续谱上量化肌成纤维细胞活化的研究策略而产生。肌成纤维细胞活化状态的评估通常依赖细胞形态与特定标记物的联合观察,而本数据集正是为支撑这一量化策略提供原始图像材料。数据集被归入皮肤与结缔组织疾病以及日光性角化病分类之下,主题标签包括 Medicine, Health and Life Sciences 与 Microscopy,说明其面向医学与生命科学中的显微成像研究场景。作者为 Hillsley, Alexander,机构为 Texas Data Repository,发布时间为 2022 年。

【数据内容】

数据集的核心内容是细胞的四通道图像。具体而言,通道 1 为 F-Actin,通道 2 为 alpha smooth muscle actin,通道 3 为 DAPI,通道 4 为 Phase-contrast。这四个通道分别对应细胞骨架、平滑肌肌动蛋白标记、细胞核染色以及相差成像,构成了对同一细胞样本的多维度显微观察记录。除上述通道信息外,源站未提供关于图像数量、分辨率、文件格式或样本规模的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 doi.org,发布机构为 Texas Data Repository,作者为 Hillsley, Alexander,发布时间为 2022 年。源站描述仅说明这些四通道图像用于相关手稿,未提供具体的采集设备、成像参数、实验条件或样本来源等细节,因此这些方面的信息源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与通道构成,该数据集适用于医学、健康与生命科学领域的显微成像研究,尤其是涉及细胞骨架、平滑肌肌动蛋白与细胞核标记联合观察的场景。其分类归属提示其可服务于皮肤与结缔组织疾病及日光性角化病相关研究方向。由于包含相差通道,也可用于结合形态学信息与荧光标记信息的综合分析。具体应用范围以源站描述为准,源站未提供更详细的应用说明。

【使用方法】

源站未提供关于数据加载、通道配准、预处理或分析流程的具体说明。使用者可依据四通道图像的通道定义(F-Actin、alpha smooth muscle actin、DAPI、Phase-contrast)自行组织观察与分析,但源站未提供配套的代码、协议或操作指南。

【质量与限制】

源站未提供关于图像质量、采集标准、标注准确性或数据完整性的评估信息。该数据集仅包含图像数据,源站描述未提及配套的定量测量结果、元数据表或质控报告。使用时应以源站描述所界定的四通道图像内容为限,源站未提供其他质量相关说明。

【引用与许可】

该数据集作者为 Hillsley, Alexander,机构为 Texas Data Repository,发布时间为 2022 年,来源站为 doi.org。源站未提供具体的许可条款或引用格式说明,相关引用与许可信息以来源站公布内容为准。

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源站:https://doi.org/10.18738/T8/SDMFU3

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

4 channel images of cells used in the manuscript channel 1: F-Actin channel 2: alpha smooth muscle actin channel 3: DAPI channel 4: Phase-contrast

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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