长链饱和脂肪酸局部处理痤疮小鼠模型皮肤组织的单细胞RNA测序
该数据集为痤疮小鼠模型经长链饱和脂肪酸局部处理后的皮肤组织单细胞RNA测序数据。样本来自7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳部，涂抹5%（w/w）棕榈酸乙酯乙醇溶液后，于0、6、12小时采集耳组织，经单细胞悬液制备、液滴法单细胞捕获、RNA提取及文库构建，在Illumina NovaSeq 6000平台
基本信息
资源简介
长链饱和脂肪酸局部处理痤疮小鼠模型皮肤组织的单细胞RNA测序
PRJDB37389 数据集收录了痤疮小鼠模型经长链饱和脂肪酸局部处理后的皮肤组织单细胞RNA测序数据。样本取自7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳部，以5%（w/w）棕榈酸乙酯（C16:0）乙醇溶液局部涂抹，并于处理后0、6、12小时采集耳组织，经单细胞悬液制备、液滴法单细胞捕获、RNA提取和文库构建，在Illumina NovaSeq 6000平台上完成测序。三个时间点分别分析9,234、12,885和13,395个细胞。该数据属于转录组或基因表达主题，归入皮肤与结缔组织疾病/痤疮方向，可用于考察长链饱和脂肪酸局部刺激下皮肤组织细胞组成与基因表达的时间动态变化。
【数据集背景】
痤疮是皮肤与结缔组织疾病领域关注的问题之一。该数据集以痤疮小鼠模型为对象，采用长链饱和脂肪酸中的棕榈酸乙酯（C16:0）作为局部处理因素，配制成5%（w/w）乙醇溶液后涂抹于小鼠耳部，并在处理后不同时间点获取耳组织进行单细胞转录组分析。其设计意图在于从单细胞分辨率记录局部处理早期（0至12小时）皮肤组织的基因表达状态，为相关研究提供转录组层面的数据基础。
【数据内容】
数据内容为单细胞RNA测序数据，主题标签为转录组或基因表达。样本来自经棕榈酸乙酯乙醇溶液局部处理的7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳组织，覆盖处理后0小时、6小时和12小时三个时间点。三个时间点分别获得9,234、12,885和13,395个细胞用于分析。数据经过单细胞悬液制备、液滴法单细胞捕获、RNA提取及文库构建等流程，测序在Illumina NovaSeq 6000平台上完成。除上述信息外，源站未提供更细化的数据文件构成说明。
【采集与来源】
样本采集自痤疮小鼠模型的耳部组织。该模型为7周龄雌性C57BL/6J小鼠，耳部局部涂抹以乙醇配制的5%（w/w）棕榈酸乙酯（C16:0）溶液。于处理后0、6、12小时采集耳组织，随后制备单细胞悬液，进行液滴法单细胞捕获、RNA分离和文库构建，并使用Illumina NovaSeq 6000平台测序。数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov。
【适用场景】
该数据集适用于在单细胞水平考察皮肤组织在长链饱和脂肪酸局部处理后的转录组变化，尤其是处理后0至12小时范围内的早期响应。可用于比较三个时间点之间细胞群体构成与基因表达差异，也可作为痤疮相关皮肤炎症与脂质刺激研究的转录组参考数据。适用分析包括单细胞层面的细胞类型识别、时间序列表达比较以及差异表达探索等。
【使用方法】
使用时可依据0小时、6小时和12小时三个时间点组织样本，分别对应9,234、12,885和13,395个细胞的分析结果，开展时间点间的比较分析。由于数据为单细胞RNA测序，常规分析流程可包括质控、细胞聚类、细胞类型注释和差异表达分析。具体文件格式、原始数据与处理后数据的组织方式以及分析参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于Illumina NovaSeq 6000平台测序，三个时间点分别分析9,234、12,885和13,395个细胞，样本来自7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳部，处理为5%（w/w）棕榈酸乙酯乙醇溶液局部涂抹。除上述信息外，源站未提供测序深度、细胞质控指标、重复样本数量及批次信息等质量相关细节。数据仅覆盖0、6、12小时三个时间点，时间跨度有限；物种为小鼠，向其他物种外推需谨慎。其他限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB37389
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
样本取自痤疮小鼠模型，其中将棕榈酸乙酯（C16:0）配制成5%（w/w）乙醇溶液，局部涂抹于7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳部。为进行单细胞RNA测序分析，在涂抹后0、6和12小时采集耳组织。制备单细胞悬液，并进行基于液滴的单细胞捕获、RNA分离和文库构建。分别从0小时、6小时和12小时样本中分析了9,234、12,885和13,395个细胞。测序使用Illumina NovaSeq 6000平台进行。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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