PRJDB36936：长链饱和脂肪酸局部处理痤疮小鼠模型皮肤组织的bulk RNA-seq分析
该数据集来自 NCBI，为痤疮小鼠模型的皮肤组织 bulk RNA-seq 数据。实验将棕榈酸乙酯（C16:0）以 5%（w/w）乙醇溶液局部涂抹于 7 周龄雌性 C57BL/6J 小鼠耳部，以乙醇为对照，并另用硬脂酸乙酯（C18:0）比较不同脂肪酸的效应
基本信息
资源简介
PRJDB36936：长链饱和脂肪酸局部处理痤疮小鼠模型皮肤组织的bulk RNA-seq分析
PRJDB36936 是一个聚焦痤疮相关皮肤转录组变化的数据集，来源于 NCBI。该数据集围绕痤疮小鼠模型展开，采用 bulk RNA-seq 技术分析局部涂抹长链饱和脂肪酸后皮肤组织的基因表达情况。实验以 7 周龄雌性 C57BL/6J 小鼠为对象，将棕榈酸乙酯（C16:0）配制成 5%（w/w）乙醇溶液涂抹于小鼠耳部，并以乙醇作为对照；同时另设硬脂酸乙酯（C18:0）处理组，用于比较不同脂肪酸之间的效应差异。涂抹后 6 小时采集耳组织，利用 Illumina NovaSeq 6000 平台进行转录组测序。该数据集属于皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮分类，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，可为痤疮发病机制及脂肪酸相关皮肤反应研究提供转录组层面的数据参考。
【数据集背景】
痤疮是一种常见的皮肤与结缔组织疾病，其发生发展与皮脂分泌、毛囊角化及局部炎症等因素相关。该数据集以痤疮小鼠模型为研究对象，关注长链饱和脂肪酸局部作用后皮肤组织的转录组响应。源站描述显示，实验使用棕榈酸乙酯（C16:0）作为处理物，并以乙醇作为对照，同时引入硬脂酸乙酯（C18:0）以比较不同脂肪酸的效应。这一设计使数据集可用于观察特定脂肪酸暴露下皮肤组织基因表达的变化，并为痤疮相关皮肤生物学研究提供基础数据。
【数据内容】
该数据集为 bulk RNA-seq 数据，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。样本来自经局部涂抹处理后的痤疮小鼠模型耳组织。实验涉及棕榈酸乙酯（C16:0）处理、乙醇对照以及硬脂酸乙酯（C18:0）处理，测序在 Illumina NovaSeq 6000 平台上完成。数据内容对应皮肤组织的转录组或基因表达信息，可用于比较不同处理条件下基因表达层面的差异。关于样本数量、测序深度、数据文件格式及具体基因表达矩阵等信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集自 7 周龄雌性 C57BL/6J 小鼠的耳部组织。处理方式为局部涂抹：棕榈酸乙酯（C16:0）以 5%（w/w）乙醇溶液形式施用，乙醇作为对照，硬脂酸乙酯（C18:0）也用于处理以比较不同脂肪酸的效应。耳组织在涂抹后 6 小时采集，随后进行 bulk RNA-seq，测序平台为 Illumina NovaSeq 6000。关于组织保存方式、RNA 提取方法、文库构建细节及伦理审批信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于痤疮相关皮肤组织的转录组研究，尤其是长链饱和脂肪酸局部暴露后基因表达变化的分析。可用于比较棕榈酸乙酯（C16:0）处理与乙醇对照之间的转录组差异，也可用于比较棕榈酸乙酯（C16:0）与硬脂酸乙酯（C18:0）处理之间的效应差异。此外，该数据集可作为痤疮小鼠模型皮肤组织 bulk RNA-seq 分析的参考数据，服务于皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮方向的基因表达研究。关于具体分析流程、差异表达基因列表及通路富集结果，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 ncbi.nlm.nih.gov 获取，具体访问路径、项目编号对应的数据下载方式及文件组织方式，源站未提供。使用时可根据实验设计区分棕榈酸乙酯（C16:0）处理组、乙醇对照组和硬脂酸乙酯（C18:0）处理组，并结合 bulk RNA-seq 数据开展转录组比较分析。由于源站未提供样本数量、测序深度及数据处理细节，使用前应依据源站实际提供的信息确认数据结构和分析可行性。
【质量与限制】
该数据集基于 Illumina NovaSeq 6000 平台进行 bulk RNA-seq，样本来自 7 周龄雌性 C57BL/6J 小鼠耳部组织，采集时间为涂抹后 6 小时。实验设置了乙醇对照及硬脂酸乙酯（C18:0）比较组，有助于控制和处理比较。但源站未提供样本数量、重复设置、测序质量指标、数据过滤标准及批次信息，相关质量评估需依据源站实际数据判断。该数据集仅反映特定时间点、特定组织及特定小鼠模型下的转录组信息，外推至其他物种、其他皮肤部位或其他时间点时需谨慎。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，引用方式、许可条款及使用限制源站未提供。使用时应遵循源站发布的相关规定，并依据源站信息确认是否需要引用原始项目或相关发表成果。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJDB36936
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
样本取自痤疮小鼠模型，其中将棕榈酸乙酯（C16:0）配制成5%（w/w）乙醇溶液，局部涂抹于7周龄雌性C57BL/6J小鼠耳部，并以乙醇作为对照。为进行比较，还涂抹了硬脂酸乙酯（C18:0），以考察不同脂肪酸之间的差异。涂抹后6小时采集耳组织，并使用Illumina NovaSeq 6000平台进行bulk RNA-seq。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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