越南HIV阴性肺结核或肺外结核成人尿液脂阿拉伯甘露聚糖水平数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A4850dd48989f797be094b3bcdaead33f297a5321b4945f35aaa7094d68ef5f94

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

需要采用非痰标本的结核病（TB）诊断检测方法。脂阿拉伯甘露聚糖（LAM）是一种分枝杆菌细胞壁糖脂，经尿液排出，一直是结核病快速诊断检测（RDT）的靶标。虽然尿液LAM（uLAM）快速诊断检测已获批用于HIV感染者（PLWH），但关于HIV阴性成人结核病患者的uLAM浓度数据有限。我们在越南河内国家肺病医院开展了一项纵向队列研究，纳入年龄≥18岁、因结核相关症状就诊的成人。采集尿液标本，采用两种不同的捕获抗体（S4-20和FIND28）及相同的检测抗体（A194-01），通过电化学发光免疫分析法测定uLAM浓度。采集痰标本进行GeneXpert Ultra检测和结核培养，两者结合以确定微生物学参考标准（MRS）。当临床有指征时，针对可能的肺外结核进行额外的微生物学检测。在纳入的745名参与者中，335名（44.9%）患有肺结核，53名（7.1%）患有肺外结核。

[可补充一行关于两种抗体对估计的uLAM平均浓度的内容]。本研究中，S4-20/A194-01（S/A）在总体人群和TB阳性队列中测得的uLAM平均浓度分别为109 pg/mL和553 pg/mL。FIND28/A194-01（F/A）抗体对在总体人群和TB阳性队列中测得的uLAM平均浓度分别为1389 pg/mL和4570 pg/mL。总体而言，相较于MRS，S4-20/A194-01（S/A）抗体对的敏感性和特异性分别为38%（95%置信区间[CI] 0.33，0.44）和98%（95% CI 0.96，0.99）。FIND28/A194-01（F/A）抗体对的敏感性和特异性分别为41%（95% CI 0.35，0.47）和80%（95% CI 0.75，0.84）。使用S/A的合并uLAM平均浓度为51.0 pg/mL，而F/A为78.0 pg/mL。使用筛选样本进行的受试者工作特征分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。