PXD008786：安东·契诃夫书信的蛋白质组学研究

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD008786

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对保存在莫斯科附近梅利霍沃的A. Chekhov博物馆中的五件不同的信件和明信片，以及安东·契诃夫临终时在其病榻上穿着的衬衫，通过将EVA（一种乙烯-醋酸乙烯酯箔片，其上嵌有粉碎的强阴离子和强阳离子交换剂以及C8树脂）圆片施加到这些表面上进行了分析。用高分辨质谱分析了三种不同的洗脱液（分别在酸性和碱性条件下以及用乙腈获得）。采用宏蛋白质组学方法描述了样品上存在的环境微生物群以及结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）菌株。八种已鉴定的结核分枝杆菌蛋白证实了该细菌的存在以及契诃夫的死因，此外还鉴定出若干属于其他细菌物种的已测序肽。在衬衫上一小块血斑中检测到的人血浆蛋白和人角蛋白，证明了这种联合方法的强大能力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。