PRJEB126695:哈萨克人群结核病遗传易感性

数据围绕哈萨克人群结核病遗传易感性这一研究主题,属于人类相关生物项目,可用于探索宿主遗传因素与结核病易感性之间的关联。源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录,并提供指向该项目所产生多种数据类型的链接,未提供样本量、具体基因位点或实验方法等细节(来源 NCB

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基因组分类Other
PRJEB126695: Genetic susceptibility to tuberculosis in the Kazakh population

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJEB126695:哈萨克人群结核病遗传易感性

PRJEB126695 是一个围绕哈萨克人群结核病遗传易感性主题建立的生物项目数据集,源站标题为“Homo sapiens (ID 1534261) - BioProject - NCBI”,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集在本站被归类于呼吸系统疾病下的肺结核方向,主题标签为“Other”。从整体定位看,它属于人类相关生物项目,核心研究关注点是宿主遗传因素与结核病易感性之间的关联,面向的是希望了解或再利用该项目所产生数据的研究人员。源站描述仅说明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的记录,并提供指向该项目所产生多种数据类型的链接,未提供样本量、具体基因位点或实验方法等细节。

【数据集背景】

该数据集对应的研究主题是哈萨克人群结核病的遗传易感性。结核病是一种由病原体引起的传染病,宿主遗传背景被认为可能影响个体对结核病的易感程度。该生物项目以人类为研究对象,项目标题明确指向哈萨克人群,说明其研究人群具有特定的群体遗传背景。源站将其记录为 BioProject,意味着它并非单一实验或单一数据文件,而是围绕“哈萨克人群结核病遗传易感性”这一研究计划所汇集的生物数据集合。该记录在本站被归入呼吸系统疾病 / 肺结核分类,主题标签为“Other”。

【数据内容】

源站描述指出,BioProject 记录为用户提供一个统一入口,用于查找该项目所产生的多种数据类型。因此,该数据集的内容应理解为与“哈萨克人群结核病遗传易感性”研究计划相关的多种生物数据的集合,而非某一特定类型的数据文件。关于具体包含哪些数据类型、样本量、具体基因位点或实验方法等细节,源站未提供。主题标签为“Other”,本站分类为呼吸系统疾病 / 肺结核。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Homo sapiens (ID 1534261) - BioProject - NCBI”。数据集英文名为“PRJEB126695: Genetic susceptibility to tuberculosis in the Kazakh population”。源站描述说明,BioProject 可源自单一组织或联盟,是围绕单一研究计划汇集的生物数据。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集的主题,其适用场景包括:探索宿主遗传因素与结核病易感性之间的关联;围绕哈萨克人群这一特定群体开展结核病遗传易感性相关研究;通过 BioProject 记录查找该项目所产生的多种数据类型,并据此进行数据再利用或整合分析。该数据集属于人类相关生物项目,本站分类为呼吸系统疾病 / 肺结核。关于具体可支持的分析类型、统计方法或验证场景,源站未提供。

【使用方法】

源站描述指出,BioProject 记录为用户提供一个单一入口,用于找到指向该项目所产生多种数据类型的链接。因此,使用该数据集时,应以该 BioProject 记录为入口,访问其链接的各类数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、访问权限、分析流程或工具要求,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 记录,源站描述仅说明其作为生物数据集合与链接入口的性质,未提供样本量、具体基因位点或实验方法等细节。因此,在评估其质量与适用性时,可确认的信息限于项目主题、研究对象、来源站与分类标签。关于数据完整性、测序深度、质控指标、批次效应、群体分层控制等质量相关信息,源站未提供。使用时应以源站记录及其链接的原始数据说明为准。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为“Homo sapiens (ID 1534261) - BioProject - NCBI”,数据集英文名为“PRJEB126695: Genetic susceptibility to tuberculosis in the Kazakh population”。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、数据许可协议或使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB126695

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目呈现了一个全面的基因分型数据集,包含164名哈萨克族个体,其中80名为健康对照,84名为结核病患者。两组的选择均旨在尽量减少通常与结核病易感性相关的社会和环境因素的影响。基因组DNA样本通过哈萨克斯坦各地的当地医疗机构收集,并使用Illumina Infinium ImmunoArray-24 v2.0进行基因分型。该数据集为研究哈萨克族人群结核病易感性的遗传因素提供了机会,同时考虑了传统的社会和环境风险因素。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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