结核分枝杆菌感染WT与miR-155-/-骨髓来源巨噬细胞的基因表达数据[时间序列]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE79731

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

结核分枝杆菌（Mtb）与宿主之间复杂的相互作用在感染过程中如何被调控，目前仍不十分清楚。在此，我们采用系统生物学方法证明，miR-155是调控巨噬细胞感染Mtb后最初48小时内宿主基因表达的若干microRNA之一。miR-155通过SHIP1/AKT信号通路调控感染Mtb的巨噬细胞的细胞存活。利用时间进程基因表达数据，我们构建了野生型（WT）巨噬细胞对Mtb感染先天免疫应答的miRNA调控网络。该网络提示七种miRNA在调控宿主对Mtb的应答中发挥作用，miR-155是其中之一。随后，我们通过比较WT与miR-155-/-巨噬细胞之间的应答，验证了miR-155的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。