GSE315842:巨细胞病毒作为结核分枝杆菌加重风险因素——Mtb-CMV小鼠模型感染的建立

主题标签:肺结核、巨细胞病毒、结核分枝杆菌、小鼠感染模型、呼吸系统疾病、基因表达。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。本数据集为呼吸系统疾病领域公开数据集,主题涵盖肺结核。

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基因组分类肺结核巨细胞病毒结核分枝杆菌小鼠感染模型呼吸系统疾病基因表达
GSE315842: Cytomegalovirus as a risk factor for exacerbation of Mycobacterium tuberculosis: development of a Mtb-CMV mouse model infection

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE315842:巨细胞病毒作为结核分枝杆菌加重风险因素——Mtb-CMV小鼠模型感染的建立

GSE315842 是一个聚焦呼吸系统疾病中肺结核方向的公开基因表达数据集,其英文全称为“Cytomegalovirus as a risk factor for exacerbation of Mycobacterium tuberculosis: development of a Mtb-CMV mouse model infection”。该数据集围绕巨细胞病毒作为结核分枝杆菌感染加重风险因素这一主题,构建了 Mtb-CMV 小鼠感染模型,用于相关基因表达研究。数据集在分类上归属于呼吸系统疾病 / 肺结核,来源站为 usebiotransfer.org,原始数据登记于 NCBI Gene Expression Omnibus(GEO)。其主题标签涵盖肺结核、巨细胞病毒、结核分枝杆菌、小鼠感染模型、呼吸系统疾病与基因表达,适合关注结核病与病毒共感染机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

肺结核由结核分枝杆菌引起,是呼吸系统疾病领域的重要研究主题。该数据集关注巨细胞病毒(Cytomegalovirus)作为结核分枝杆菌感染加重的风险因素,并通过建立 Mtb-CMV 小鼠感染模型来开展研究。这一主题设置体现了将病毒共感染因素纳入结核病发病机制研究的思路,数据集名称本身即明确了其研究定位:以巨细胞病毒为风险因素,探讨其对结核分枝杆菌感染加重的影響,并依托小鼠模型进行感染建模。数据集所属分类为呼吸系统疾病 / 肺结核,与上述研究主题一致。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括肺结核、巨细胞病毒、结核分枝杆菌、小鼠感染模型、呼吸系统疾病与基因表达。从标签构成看,数据内容涉及在上述小鼠感染模型背景下产生的基因表达数据,服务于肺结核与巨细胞病毒共感染相关的研究问题。数据集英文名称中“development of a Mtb-CMV mouse model infection”表明其与 Mtb-CMV 小鼠感染模型的建立相关。关于样本数量、分组设计、检测平台、基因数量等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 usebiotransfer.org,源站描述指向 NCBI Gene Expression Omnibus 的 GSE315842 条目,并给出了对应的访问链接 https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE315842/。数据集在来源站被归类为呼吸系统疾病 / 肺结核。关于样本采集的具体时间、地点、实验操作流程与伦理审批信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集适用于呼吸系统疾病特别是肺结核方向的研究场景,例如探讨巨细胞病毒作为风险因素对结核分枝杆菌感染加重的作用、围绕 Mtb-CMV 小鼠感染模型开展基因表达层面的分析,以及结核病与病毒共感染相关机制研究的参考与比较。关于更具体的适用分析类型与方法学建议,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为公开数据集,可通过源站给出的链接 https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE315842/ 访问,并可按源站描述追溯至 NCBI Gene Expression Omnibus 的 GSE315842 条目获取数据。关于数据下载格式、预处理步骤、分析流程与软件参数等使用细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集登记于 NCBI Gene Expression Omnibus,并通过 usebiotransfer.org 提供检索入口,具备公开可追溯的来源信息。其研究范围限定于 Mtb-CMV 小鼠感染模型相关的基因表达主题,结论外推到其他物种或人群时需谨慎。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量充分性等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站描述中的形式:NCBI Gene Expression Omnibus, GSE315842: Cytomegalovirus as a risk factor for exacerbation of Mycobacterium tuberculosis: development of a Mtb-CMV mouse model infection [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE315842/。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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源站:https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE315842

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NCBI Gene Expression Omnibus, GSE315842: Cytomegalovirus as a risk factor for exacerbation of Mycobacterium tuberculosis: development of a Mtb-CMV mouse model infection [Dataset]. https://usebiotransfer.org/tools/geo-finder/GSE315842/

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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