结节病中结核分枝杆菌特异性血液免疫特征数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE287043

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

结节病是一种主要累及肺部的肉芽肿性系统性炎症性疾病。它与结核病（TB）在组织病理学、临床和免疫学特征上存在共同之处。目前尚无能够正式确诊结节病的诊断性检测方法；临床医生首先需要排除包括结核病在内的其他疾病。我们采用流式细胞术和转录组学方法，比较了肺结节病患者、活动性结核病（ATB）患者以及结核分枝杆菌（Mtb）致敏和非致敏健康对照者血液中针对Mtb的特异性免疫应答特征。我们发现，结节病与以下特征相关：i）针对Mtb肽段和Mtb裂解物的抗原反应性T细胞频率显著降低；ii）体外及体外刺激后单核细胞频率升高；iii）与Mtb感染组和健康对照组相比，吞噬相关基因表达增加。在Mtb刺激的外周血单个核细胞（PBMC）中，联合Mtb特异性T细胞与单核细胞基因特征或流式细胞术特征，能够以高特异性和高灵敏度有效区分结节病与活动性结核病，并在较低程度上区分结节病与Mtb致敏及非致敏健康对照者。

这些生物标志物为开发有效的结节病诊断测试提供了有前景的方向，特别是在与结核病的鉴别诊断方面。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。