结核Ag85B-Fc2a缓解小鼠过敏性哮喘的全转录组与蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269136

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在早期阶段，构建了OVA诱导的小鼠过敏性哮喘模型，并用Ag85B-Fc2a融合蛋白进行治疗，证实Ag85B-Fc2a融合蛋白能够减少肺部炎症细胞浸润，对哮喘具有治疗作用。为进一步探究其作用机制，我们开展了转录组学和蛋白质组学测序，筛选出相关基因和蛋白，对其进行富集分析，并重点关注差异显著的通路。后期将通过q-PCR和Western-blot实验进行验证。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。