MR1限制性T细胞克隆型与结核分枝杆菌感染抗性相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE264592

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数据说明

T细胞是抵抗结核分枝杆菌感染保护性免疫所必需的。我们最近描述了一组乌干达结核病病例的家庭接触者，他们似乎“抵抗”结核分枝杆菌感染（抵抗者；RSTRs），并显示这些个体对结核分枝杆菌特异性肽抗原具有IFN-γ非依赖性T细胞反应。然而，T细胞也通过独立于遗传背景的抗原呈递系统识别非蛋白质抗原，这些T细胞被称为供体非限制性T细胞（DURTs）。我们使用四聚体染色和流式细胞术来表征DURTs与“抵抗”结核分枝杆菌感染之间的关联。大多数DURT亚群的外周频率在RSTRs和潜伏感染对照组（LTBIs）之间相当。然而，我们观察到与LTBIs相比，RSTRs中MR1限制性T（MR1T）细胞的频率增加了1.65倍。对从8名供者分选的18,251个MR1T细胞进行单细胞RNA测序，揭示了5,150个克隆型，这些克隆型表达了一种共同的转录程序，其中大多数是私有的。

T细胞受体α/T细胞受体δ（TCRα/δ）库的测序显示，在RSTR中，几种DURT克隆型发生了扩增，其中包括2种以TCR依赖方式识别分枝杆菌感染细胞的MR1T克隆型。总体而言，我们的数据揭示了人类MR1T细胞TCR库中出乎意料的供者特异性多样性，以及分枝杆菌反应性MR1T克隆型与结核分枝杆菌感染抵抗力之间的关联。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。