分枝杆菌依赖的microRNA-142-3p表达降低WASP家族蛋白并调控吞噬作用
该数据集来自NCBI GEO,标题为分枝杆菌依赖的microRNA-142-3p表达降低WASP家族蛋白并调控吞噬作用,属于呼吸系统疾病/肺结核分类

基本信息
资源简介
分枝杆菌依赖的microRNA-142-3p表达降低WASP家族蛋白并调控吞噬作用
Mycobacteria-Dependent Expression of microRNA-142-3p Reduces WASP Family Proteins and Controls Phagocytosis
该数据集来自NCBI GEO,标题为分枝杆菌依赖的microRNA-142-3p表达降低WASP家族蛋白并调控吞噬作用,属于呼吸系统疾病/肺结核分类。数据为非编码RNA芯片表达谱,包含1个文件GSE23429_series_matrix.txt.gz,平台为GPL9347,物种为小鼠(10090)。研究通过全基因组表达谱分析鉴定分枝杆菌感染后差异调控的miRNA,可用于探索miRNA在结核分枝杆菌吞噬早期事件中的调控作用及WASP家族蛋白相关机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 04 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):吞噬作用需要激活大量机制,其中包括由Arp2/3复合体引导的肌动蛋白细胞骨架的激活。这些机制由Wiskott Aldrich综合征蛋白(WASP)家族成员等激活因子促进。为了进一步理解致病性结核分枝杆菌吞噬早期事件涉及的分子机制,我们着手利用全基因组表达谱分析来鉴定分枝杆菌感染后差异调控的miRNA,以检查miRNA在吞噬作用中的潜在作用。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL9347、10090。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE23429
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 17 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
吞噬作用需要激活大量机制,其中包括由Arp2/3复合体引导的肌动蛋白细胞骨架的激活。这些机制由Wiskott Aldrich综合征蛋白(WASP)家族成员等激活因子所促进。为了进一步理解致病性结核分枝杆菌吞噬早期事件所涉及的分子机制,我们着手利用全基因组表达谱分析来鉴定分枝杆菌感染后差异调控的miRNA,从而研究miRNA在吞噬作用中的潜在作用。在小鼠巨噬细胞被非致病性耻垢分枝杆菌感染后激活的miRNA之一——高度保守的miR-142-3p——被预测并证实靶向神经型WASP(N-WASP)。在感染活致病性和非致病性分枝杆菌后,小鼠巨噬细胞中miR-142-3p的上调与N-WASP水平呈负相关,提示结核分枝杆菌在宿主细胞转录后水平对吞噬作用调控中发挥积极作用。
N-WASP的减少与每个巨噬细胞内细菌内化减少相关,且不依赖于吞噬指数。此外,WASP水平的下调在早期时间点伴随N-WASP的下调,但在晚期时间点则不然,提示这两个家族成员之间存在密切的调控机制,且该机制依赖于吞噬作用的时间框架。另外,上调miR-142-3p以不依赖吞噬作用的方式促进了另一个被预测并确认的靶标——Cofilin2蛋白水平的变化。下调实验促进了巨噬细胞中异常形态表型的出现,类似于其他人在Wiskott Aldrich综合征人类PBMCs中观察到的现象,提示miR-142-3p强烈参与巨噬细胞中肌动蛋白机制的调控。总之,这些结果首次表明miRNA参与了
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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