黏膜暴露非结核分枝杆菌诱导B细胞介导的肺结核保护

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE203037

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

卡介苗（BCG）是唯一获批用于预防结核分枝杆菌（Mtb，结核病的致病菌）的疫苗。然而，BCG的保护效力有限，因此需要开发更好的疫苗。非结核分枝杆菌（NTM）是与Mtb不同的一个谱系，是环境中存在的一种机会性病原体。结核病流行国家的人群对NTM的暴露程度更高，但既往研究尚未阐明NTM暴露与BCG效力之间的关系。因此，我们建立了一种小鼠模型（BCG+NTM），该模型模拟了人类在早期阶段接种BCG疫苗以及通过口服途径持续暴露于NTM的情况，包括在结核感染期间。我们的结果表明，与单独接种BCG的小鼠相比，BCG+NTM小鼠对肺结核的保护作用增强，这与肺部B细胞流入增加、血清和气道中抗Mtb IgA和IgG抗体滴度升高相关。值得注意的是，通过空间转录组学检测，BCG+NTM小鼠的肺部形成了表达生发中心形成标志物的B细胞聚集体。

我们得出结论，非结核分枝杆菌（NTM）暴露与结核病防护之间存在直接相关性，其中B细胞发挥着关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。