血色病驱动高产yersiniabactin假结核耶尔森菌急性致死性肠道反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE180888

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

血色病（铁过载）会增加宿主对嗜铁细菌感染的易感性，从而引发严重并发症，但其潜在机制仍不清楚。本研究表明，口服感染高产耶尔森菌素（Ybt）的假结核耶尔森菌Δfur突变株（称为Δfur）会导致血色病小鼠发生严重全身性感染和急性死亡，其原因是肠道屏障被迅速破坏。对Δfur感染肠道的转录组分析显示，细胞因子-细胞因子受体相互作用、补体和凝血级联、NF-κB信号通路以及趋化因子信号通路表达上调，而细胞黏附分子和TLR信号通路表达下调。进一步研究表明，感染Δfur的血色病小鼠中触发的IL-1b信号失调通过激活肌球蛋白轻链激酶（MLCK）和过度中性粒细胞增多破坏肠道屏障。抑制MLCK活性或清除中性粒细胞浸润可减少屏障破坏，在很大程度上改善免疫病理，并显著挽救血色病小鼠免于致死性Δfur感染。

此外，对IL-1b过度产生的早期干预能够完全使血色病小鼠免于致命性感染。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。