血浆外泌体miRNA表达数据[Affymetrix miRNA 4.0]
该数据集为从血浆中提取的外泌体miRNA表达数据,采用Affymetrix miRNA 4.0芯片平台检测,属于非编码RNA表达谱分析
![GSE116542: Expression data of exosomal miRNAs extracted from plasma [Affymetrix miRNA 4.0]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/162585.jpg)
基本信息
资源简介
血浆外泌体miRNA表达数据[Affymetrix miRNA 4.0]
GSE116542 数据集收录了从血浆中提取的外泌体 miRNA 表达数据,采用 Affymetrix miRNA 4.0 芯片平台进行检测,属于非编码 RNA 表达谱分析。该数据集来源于 NCBI,在本站归入呼吸系统疾病下的肺结核分类,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE116542_series_matrix.txt.gz。数据集作者为 Xuejiao Hu,发布时间为 201 年 7 月 2 日。整体而言,该数据集围绕外泌体 miRNA 在结核病临床诊断中的潜在价值展开,适合关注结核病分子标志物、外泌体非编码 RNA 以及芯片表达谱分析的研究者参考使用。
【数据集背景】
结核病在复杂临床条件下的诊断存在困难,寻找能够辅助临床诊断的疾病标志物是相关研究的重要方向。外泌体 miRNA 因其在体液中的稳定性和疾病相关性,被认为是具有前景的疾病生物标志物。该数据集正是针对这一背景,旨在考察外泌体 miRNA 用于辅助结核病临床诊断的潜力,其研究出发点在源站描述中有明确说明。
【数据内容】
该数据集的内容为血浆外泌体 miRNA 的表达数据,检测平台为 Affymetrix miRNA 4.0 芯片,属于非编码 RNA 表达谱分析。数据集仅包含 1 个文件,即 GSE116542_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供。主题标签包括 Non-coding RNA profiling by array、GPL19117 与 9606,分别对应芯片型非编码 RNA 表达谱、芯片平台编号以及人类物种信息。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为“Expression data of exosomal miRNAs extracted from plasma [Affymetrix miRNA 4.0]”。样本材料为从血浆中提取的外泌体 miRNA,检测采用 Affymetrix miRNA 4.0 芯片。数据作者为 Xuejiao Hu,发布时间为 201 年 7 月 2 日。关于样本采集的具体流程、样本数量与临床分组等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于结核病诊断相关的外泌体 miRNA 标志物研究,也可用于非编码 RNA 芯片表达谱的方法学探索与比较分析。研究者可将其作为血浆外泌体 miRNA 表达数据的参考来源,用于候选 miRNA 的筛选、表达模式观察或与其他表达谱数据的对照分析。具体研究设计与分析目标应结合源站信息自行判断。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE116542_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅提供一个系列矩阵文件,分析时应以该文件所承载的表达信息为基础,结合芯片平台信息进行解读。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,数据规模有限;源站未提供样本量、临床分组、质控指标及归一化处理细节等信息,因此难以对数据质量作出全面评估。此外,发布时间标注为“Jul 02 201”,年份信息不完整。使用者在解释结果时应注意这些限制,避免过度推断。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。使用该数据集时,建议遵循 NCBI 及原数据作者的相关要求,并关注数据使用条款的具体说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE116542
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在复杂的临床条件下,结核病(TB)难以诊断。外泌体miRNA已成为有前景的疾病生物标志物。我们旨在探究外泌体miRNA辅助结核病临床诊断的潜力。在本研究中,我们使用Affymetrix Genechip miRNA 4.0 Array芯片来研究外周血浆外泌体中差异表达miRNA(DEMs)的图谱。结果,外泌体miRNA谱分析在结核病患者(肺结核和结核性脑膜炎)与对照之间共获得102个DEMs(98个上调表达,4个下调表达)。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




