基于新生物标志物方法改进儿童结核性脑膜炎诊断的评估

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04308928

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数据说明

疾病：结核性脑膜炎。引言：在持续开展的研究中，仍缺乏针对结核性脑膜炎（TBM）的早期且具有成本效益的诊断工具。在脑脊液（CSF）中检测结核分枝杆菌（Mtb）是诊断TBM的金标准。遗憾的是，涂片显微镜检查和培养对TBM的敏感性均较低。根据所采用的参考标准不同，GeneXpert检测（Cepheid公司，美国）对TBM的敏感性约为50-60%，在一项研究中使用离心后的脑脊液可提高至72%。然而，在最近发表的一项针对HIV阳性成人的研究中，GeneXpert的敏感性为43%或45%，培养的敏感性为43%或45%，而GeneXpert Ultra的敏感性为70%或95%，具体取决于所采用的两种参考标准中的哪一种。尽管GeneXpert检测在南非的推广率相对较高，但目前该检测主要在集中化实验室提供。该检测在其他非洲国家的可及性有限。结核病的诊断依赖于敏感性较低的症状筛查和涂片显微镜检查，尤其是在农村卫生中心。

Mtb培养设施通常仅在转诊级实验室配备，结果可能需要长达42天才能获得。多次就医的需求导致失访和诊断延迟，从而助长结核病传播和晚期肺损伤。尤其对于TBM，正确诊断往往只能在三级转诊中心入院后才能作出。在常规临床实践中，诊断主要基于临床表现、多项脑脊液实验室检查、影像学发现以及排除常见鉴别诊断的综合判断。这些技术中的大多数在撒哈拉以南非洲大部分结核病高负担但资源受限的地区无法获得。在初级和二级医疗机构就诊的儿童往往经历多次错失机会，多达六次就诊后，才在相对完善的

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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