鸟分枝杆菌与结核分枝杆菌感染人巨噬细胞的比较转录组数据
该数据集来自 ebi.ac.uk,为鸟分枝杆菌(Mav)与结核分枝杆菌(Mtb)感染原代人巨噬细胞的全基因组宿主转录组分析数据,主题标签为 RNA-seq of total RNA 与 Homo sapiens,本站归类于呼吸系统疾病/肺结核

基本信息
资源简介
鸟分枝杆菌与结核分枝杆菌感染人巨噬细胞的比较转录组数据
Comparative transcriptomic analysis of human macrophages during Mycobacterium avium versus Mycobacterium tuberculosis infection
该数据集来自 ebi.ac.uk,为鸟分枝杆菌(Mav)与结核分枝杆菌(Mtb)感染原代人巨噬细胞的全基因组宿主转录组分析数据,主题标签为 RNA-seq of total RNA 与 Homo sapiens,本站归类于呼吸系统疾病/肺结核。数据可用于比较两种分枝杆菌感染下宿主基因表达模式的异同,支撑宿主-病原体互作研究,并为宿主导向治疗等替代策略的探索提供转录组层面的参考(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):鸟分枝杆菌(Mav)感染导致超过80%的非结核分枝杆菌肺病,由于抗生素耐药性上升和治疗成功率不理想,其治疗仍具挑战性。因此,需要更深入地理解宿主-病原体相互作用,以指导开发替代治疗方法,如旨在改善宿主抗分枝杆菌防御的宿主导向治疗(HDT)。然而,与结核分枝杆菌(Mtb)感染相比,对Mav感染的宿主-病原体相互作用的认识仍然有限。为填补这一知识空白,我们对Mav感染的原代人巨噬细胞——主要宿主细胞——以及Mtb感染的巨噬细胞进行了全基因组宿主转录组分析,以借鉴Mtb研究的见解。我们的发现表明,基因表达模式之间存在大量重叠
【主题与分类】
主题标签:RNA-seq of total RNA、Homo sapiens。本站分类:呼吸系统疾病/肺结核。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-15473
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-15473
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Leon Mei (2026). Comparative transcriptomic analysis of human macrophages during Mycobacterium avium versus Mycobacterium tuberculosis infection [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-15473
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




