乌干达农村HIV感染者队列中COPD的气道微生物组与Th17介导炎症数据集

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05223114

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病条件：慢性阻塞性肺疾病（COPD）、HIV感染、呼吸系统疾病。

引言

HIV感染者/艾滋病患者（PLWHA）接受抗逆转录病毒治疗（ART）的可及性改善，使HIV相关发病率和死亡率下降[1]。在承担最大HIV负担的低收入和中等收入国家（LMICs），这一趋势尤为明显[2]。死亡率的降低大幅延长了预期寿命，目前PLWHA的预期寿命估计已接近一般人群[3]。因此，幸存者对慢性阻塞性肺疾病（COPD）等非传染性疾病（NCD）日益加重的负担愈发关注[4]。撒哈拉以南非洲拥有最密集的PLWHA人群，其COPD相关发病率和死亡率急剧上升，尤其是在有肺结核（PTB）病史的个体中[5]。在乌干达农村的ART诊所，我们报告COPD患病率为6.22%，PTB病史是COPD风险和肺功能下降的最强预测因素[5]。目前，对于在ART治疗下控制良好的PLWHA人群中，究竟是什么驱动了慢性肺部炎症，尚不完全清楚。

为寻找上述问题的答案，我们一直在探索气道微生物组改变在PLWHA慢性气道炎症调控中的作用。我们的研究问题已得到越来越多来自人类和动物研究的知识支持，这些研究表明，栖息于气道的细菌群落改变会触发免疫反应和慢性气道炎症[6-9]。在最近一项涉及乌干达农村地区50名HIV+COPD+、50名HIV+COPD-、50名HIV-COPD-和50名HIV-COPD-参与者的研究中，我们调查了气道微生物组改变与HIV相关COPD之间的关联（NCT040702）。对诱导痰样本进行16S测序的初步分析显示，尽管与对照组相比，合并COPD的PLWHA在细菌多样性方面存在微小差异，但属于Atopobium、Megasphaera、Actinomyces、Selenomonas、St等属的共生微生物

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。