健康与慢性OME状态下上呼吸道及中耳微生物群数据集
该数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦健康人群与慢性分泌性中耳炎(OME)患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落

基本信息
资源简介
健康与慢性OME状态下上呼吸道及中耳微生物群数据集
该数据集英文名为 The URT and Middle Ear Microbiota in Health and During Chronic OME,来源于 clinicaltrials.gov,聚焦健康人群与慢性分泌性中耳炎(OME,即“胶耳”)患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落。研究通过采集健康组与 OME 组样本,对细菌 16S 基因进行测序分析,以了解这些部位存在哪些细菌;同时对健康参与者的样本进行培养,以分离感兴趣的细菌。其目标在于识别并分离在健康人群中更常见、丰度更高的细菌,并评估这些细菌对 OME 及其他上呼吸道感染相关常见细菌的潜在保护作用。本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。
【数据集背景】
慢性分泌性中耳炎(OME)是中耳腔积液相关的疾病,常被称为“胶耳”。该研究关注健康状态与慢性 OME 状态下中耳空间及邻近上呼吸道部位的细菌群落差异,试图从微生物群落角度理解健康状态与疾病状态的不同,并进一步探索健康人群中某些更常见、更丰富的细菌是否具有对抗 OME 及其他上呼吸道感染相关细菌的潜在保护作用。研究涉及的条件包括 Otitis Media With Effusion 与 Healthy 两类。
【数据内容】
该数据集围绕健康人群与慢性 OME 患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落展开。数据获取方式包括对细菌 16S 基因进行测序,以分析样本中存在的细菌;此外,对来自健康参与者的样本进行培养,以分离感兴趣的细菌。数据集的主题标签为 Otitis Media With Effusion 与 Healthy。除上述测序分析与培养分离所对应的细菌群落信息外,源站未提供更细化的数据字段、样本数量或具体指标说明。
【采集与来源】
数据来源于 clinicaltrials.gov 登记的研究。样本采集自两组人群,即健康组与 OME 组,采集部位为中耳空间及邻近的上呼吸道部位。采集后的样本通过细菌 16S 基因测序进行分析;健康参与者的样本还被用于培养,以分离目标细菌。源站未提供采集时间跨度、采样中心数量或样本运输与保存等更详细的采集信息。
【适用场景】
该数据集可用于了解健康人群与慢性 OME 患者在中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落构成差异,支持识别在健康人群中更常见、更丰富的细菌,并为评估这些细菌对 OME 及其他上呼吸道感染相关细菌的潜在保护作用提供基础。其主题标签也表明其适用于涉及 Otitis Media With Effusion 与 Healthy 两类条件的研究语境。源站未提供其他具体应用场景的说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法、访问方式或分析流程说明。已知的分析路径为对样本进行细菌 16S 基因测序,并对健康参与者样本进行培养以分离感兴趣的细菌。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本规模、测序深度、完整性或已知偏差的说明。使用时应以源站描述所界定的研究范围为准,即健康与慢性 OME 两类人群的中耳及邻近上呼吸道部位细菌群落分析,以及健康参与者样本的细菌培养分离。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03109496
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:渗出性中耳炎、健康。本研究分析健康人群及慢性渗出性中耳炎(OME;胶耳)患者的中耳腔及邻近上呼吸道生态位中存在哪些细菌。目的是鉴定并分离在健康人群中更常见且更丰富的细菌,并评估其抵御常与OME及其他上呼吸道感染相关细菌的潜力。为此,将从两组(健康组与OME组)采集样本,并通过细菌16S基因测序进行分析。此外,将对健康参与者获得的样本进行培养,以分离目标细菌。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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