健康与慢性OME状态下上呼吸道及中耳微生物群数据集

该数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦健康人群与慢性分泌性中耳炎(OME)患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落

University Hospital, AntwerpUniversity Hospital, Antwerp
clinicaltrials
浏览 8
基因组分类Otitis Media With EffusionHealthy
The URT and Middle Ear Microbiota in Health and During Chronic OME

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

健康与慢性OME状态下上呼吸道及中耳微生物群数据集

该数据集英文名为 The URT and Middle Ear Microbiota in Health and During Chronic OME,来源于 clinicaltrials.gov,聚焦健康人群与慢性分泌性中耳炎(OME,即“胶耳”)患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落。研究通过采集健康组与 OME 组样本,对细菌 16S 基因进行测序分析,以了解这些部位存在哪些细菌;同时对健康参与者的样本进行培养,以分离感兴趣的细菌。其目标在于识别并分离在健康人群中更常见、丰度更高的细菌,并评估这些细菌对 OME 及其他上呼吸道感染相关常见细菌的潜在保护作用。本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。

【数据集背景】

慢性分泌性中耳炎(OME)是中耳腔积液相关的疾病,常被称为“胶耳”。该研究关注健康状态与慢性 OME 状态下中耳空间及邻近上呼吸道部位的细菌群落差异,试图从微生物群落角度理解健康状态与疾病状态的不同,并进一步探索健康人群中某些更常见、更丰富的细菌是否具有对抗 OME 及其他上呼吸道感染相关细菌的潜在保护作用。研究涉及的条件包括 Otitis Media With Effusion 与 Healthy 两类。

【数据内容】

该数据集围绕健康人群与慢性 OME 患者的中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落展开。数据获取方式包括对细菌 16S 基因进行测序,以分析样本中存在的细菌;此外,对来自健康参与者的样本进行培养,以分离感兴趣的细菌。数据集的主题标签为 Otitis Media With Effusion 与 Healthy。除上述测序分析与培养分离所对应的细菌群落信息外,源站未提供更细化的数据字段、样本数量或具体指标说明。

【采集与来源】

数据来源于 clinicaltrials.gov 登记的研究。样本采集自两组人群,即健康组与 OME 组,采集部位为中耳空间及邻近的上呼吸道部位。采集后的样本通过细菌 16S 基因测序进行分析;健康参与者的样本还被用于培养,以分离目标细菌。源站未提供采集时间跨度、采样中心数量或样本运输与保存等更详细的采集信息。

【适用场景】

该数据集可用于了解健康人群与慢性 OME 患者在中耳及邻近上呼吸道部位的细菌群落构成差异,支持识别在健康人群中更常见、更丰富的细菌,并为评估这些细菌对 OME 及其他上呼吸道感染相关细菌的潜在保护作用提供基础。其主题标签也表明其适用于涉及 Otitis Media With Effusion 与 Healthy 两类条件的研究语境。源站未提供其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、访问方式或分析流程说明。已知的分析路径为对样本进行细菌 16S 基因测序,并对健康参与者样本进行培养以分离感兴趣的细菌。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本规模、测序深度、完整性或已知偏差的说明。使用时应以源站描述所界定的研究范围为准,即健康与慢性 OME 两类人群的中耳及邻近上呼吸道部位细菌群落分析,以及健康参与者样本的细菌培养分离。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT03109496

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:渗出性中耳炎、健康。本研究分析健康人群及慢性渗出性中耳炎(OME;胶耳)患者的中耳腔及邻近上呼吸道生态位中存在哪些细菌。目的是鉴定并分离在健康人群中更常见且更丰富的细菌,并评估其抵御常与OME及其他上呼吸道感染相关细菌的潜力。为此,将从两组(健康组与OME组)采集样本,并通过细菌16S基因测序进行分析。此外,将对健康参与者获得的样本进行培养,以分离目标细菌。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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