气道微生物群与COPD急性加重

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.tqjq2bvw3

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数据集大小约 49.9 MB。

数据说明

目的：在一项队列研究中，探讨下气道微生物群的组成性是否能预测COPD患者日后急性加重的风险。材料与方法：我们通过支气管肺泡灌洗和保护性标本刷采集了下气道微生物群样本，并采集了122名COPD参与者的漱口液样本。从所有样本中提取细菌DNA，然后对16S RNA基因的V3-V4区域进行测序。通过电话访谈和随访访视调查中度和重度COPD急性加重的频率。比较有和无日后急性加重的参与者之间的组成分类学以及α和β多样性。结果：两组中最丰富的四个门均为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门，最丰富的四个属均为链球菌属、韦荣球菌属、普雷沃菌属和孪生球菌属。不同样本和个体之间各分类群的相对丰度显示出很大差异，在随访期间，有和无COPD急性加重的参与者之间，无论是组成分类学还是α或β多样性，均未发现统计学显著差异。

结论：本研究发现，COPD患者下呼吸道微生物群的个体差异远远超过频繁与不频繁COPD急性加重者之间的组间差异，且微生物群的组成极其复杂，将其用作后期急性加重的生物标志物面临巨大挑战。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。