SERPINA1 PiZ与PiS杂合子及SAPALDIA队列肺功能下降
该数据集来自SAPALDIA人群队列,包含超过4600名受试者的SERPINA1 S和Z等位基因基因型、基线及11年随访的肺功能与呼吸症状数据,以及炎症暴露相关代理指标

基本信息
资源简介
SERPINA1 PiZ与PiS杂合子及SAPALDIA队列肺功能下降
SERPINA1 PiZ and PiS Heterozygotes and Lung Function Decline in the SAPALDIA Cohort
该数据集来自SAPALDIA人群队列,包含超过4600名受试者的SERPINA1 S和Z等位基因基因型、基线及11年随访的肺功能与呼吸症状数据,以及炎症暴露相关代理指标。数据以4个补充表格文件形式提供,可用于分析PiMS和PiMZ杂合子在吸烟等炎症暴露亚组中肺功能纵向变化,探讨轻度或中间型alpha1-antitrypsin缺乏对呼吸健康的影响(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《SERPINA1 PiZ and PiS Heterozygotes and Lung Function Decline in the SAPALDIA Cohort》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0042728。源站首次发布:2012-08-13。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 严重alpha1-antitrypsin(AAT)缺乏是COPD的强危险因素。但导致轻度或中间型AAT缺乏的基因变异对呼吸健康纵向进程的影响仍有争议。实验研究提示,香烟烟雾等促炎因素可与这些变异交互作用,从而增加不良呼吸健康效应的风险。因此,我们在一个大型人群队列研究的不同炎症暴露亚组中,检验蛋白酶抑制剂(Pi)S或Z等位基因(PiMS和PiMZ)存在对肺功能变化的影响。方法与主要发现 SAPALDIA人群包括超过4600名受试者,从中获得S和Z等位基因的SERPINA1基因型、基线和11年随访后的肺量计检查与呼吸症状,以及i的代理指标
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个,合计 726.60 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0042728。
【主题与分类】
源站学科分类:Medicine、Genetics、Biotechnology、Immunology。主题标签:piz、pis、heterozygotes、sapaldia、cohort。本站分类:呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Genetics、Biotechnology、Immunology。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_SERPINA1_PiZ_and_PiS_Heterozygotes_and_Lung_Function_Decline_in_the_SAPALDIA_Cohort/121413
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Thun, Gian-Andri; Ferrarotti, Ilaria; Imboden, Medea; Rochat, Thierry; Gerbase, Margaret; Kronenberg, Florian; et al. (2016). SERPINA1 PiZ and PiS Heterozygotes and Lung Function Decline in the SAPALDIA Cohort. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
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使用方式
数据集获取(Figshare)
- 源站标题:<em>SERPINA1</em> PiZ and PiS Heterozygotes and Lung Function Decline in the SAPALDIA Cohort
- DOI:10.1371/journal.pone.0042728
- 发布日期:2012-08-13
- 文件数:4 个
- 文件总体积:726.60 KB
- 源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_SERPINA1_PiZ_and_PiS_Heterozygotes_and_Lung_Function_Decline_in_the_SAPALDIA_Cohort/121413
命令行下载
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curl -L -o "Table_S2.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/311431"
curl -L -o "Table_S3.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/311508"
curl -L -o "Table_S4.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/311562"
文件清单
Table_S1.pdf(253.09 KB)Table_S2.pdf(222.58 KB)Table_S3.pdf(172.39 KB)Table_S4.pdf(78.54 KB)
文件总体积 726.60 KB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
背景
重度α1-抗胰蛋白酶(AAT)缺乏是COPD的强危险因素。但导致轻度或中度AAT缺乏的基因变异对呼吸健康纵向病程的影响仍存争议。实验研究表明,香烟烟雾等促炎因素可与这些变异相互作用,从而增加不良呼吸健康效应的风险。因此,我们在一项大型人群队列研究的不同炎症暴露亚组中,检验了蛋白酶抑制剂(Pi)S或Z等位基因(PiMS和PiMZ)的存在对肺功能变化的影响。方法与主要发现
SAPALDIA人群包括4600多名受试者,可获得其S和Z等位基因的SERPINA1基因型、基线和11年随访后的肺量测定和呼吸系统症状,以及炎症状态的替代指标,如详细吸烟史、肥胖和高敏C反应蛋白(hs-CRP)。所有分析均采用多变量回归模型进行。PiMS或PiMZ基因型对肺功能变化总体上无不利影响。
我们发现,PiZ杂合性与炎症刺激因素存在交互作用的迹象,可导致作为评估轻度气道阻塞指标的测量值加速下降。基因型为PiMM的肥胖个体,其用力呼气中期流量(ΔFEF25-75%)的年均下降量为58.4 ml,而PiMZ肥胖个体的下降量达92.2 ml(p = 0.03)。持续吸烟者的相应数值差异更为显著(PiMM组66.8 ml vs. PiMZ组108.2 ml,p = 0.005)。在FEV1/FVC比值变化方面也观察到类似但较弱的关联。结论:我们认为,除已被充分证实的罕见PiZZ基因型的影响外,在以低度炎症水平升高为特征的人群亚组中,一个Z等位基因可能就足以加速肺功能下降。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0042728(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_SERPINA1_PiZ_and_PiS_Heterozygotes_and_Lung_Function_Decline_in_the_SAPALDIA_Cohort/121413)。
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