油/分散剂处理小鼠的RNA-seq数据
每个处理组包含每种性别3/4只小鼠。对处理小鼠的肺部进行了RNA-seq。该数据集被分配了GEO访问号GSE148895

基本信息
资源简介
油/分散剂处理小鼠的RNA-seq数据
该数据集为一项针对小鼠(Mus musculus)的RNA-seq研究数据,实验围绕油类与分散剂处理展开。研究中使用的动物为K-ras小鼠,处理条件包括油、Corexit 9500、Corexit 9527、9500+油、9527+油以及生理盐水对照组。每个处理组均包含每种性别3至4只小鼠。研究者对处理后小鼠的肺部组织进行了RNA-seq测序,原始数据已提交至NCBI GEO(Gene Expression Omnibus)公共数据库,并获得GEO访问号GSE148895。该数据集在主题上涉及BP石油泄漏、分散剂、Corexit 9500、Corexit 9527、K-ras小鼠、RNA-seq、肺癌、肿瘤发生以及Mus musculus等关键词,本站将其归类于呼吸系统疾病/其他类别。
【数据集背景】
该数据集来源于一项关于油类与化学分散剂暴露对小鼠肺部影响的实验研究。实验所使用的动物模型为K-ras小鼠,该模型在肿瘤发生研究中具有特定应用背景。处理条件涵盖油、Corexit 9500、Corexit 9527、油与分散剂的混合物(9500+油、9527+油)以及生理盐水对照组。研究关注的是这些处理对小鼠肺部基因表达的影响,主题标签中包含了BP石油泄漏、分散剂、肺癌和肿瘤发生等关键词,提示该研究可能与石油泄漏事件后分散剂使用相关的呼吸系统健康风险评估有关。
【数据内容】
该数据集的核心内容为小鼠肺部组织的RNA-seq数据。实验对经过不同处理的小鼠肺部进行RNA-seq测序,处理组包括油、Corexit 9500、Corexit 9527、9500+油、9527+油以及生理盐水对照组。每个处理组包含每种性别3至4只小鼠。原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO,并分配了GEO访问号GSE148895。数据集的主题标签包括BP oil spill、dispersant、Corexit 9500、Corexit 9527、K-ras mouse、RNA-seq、lung cancer、tumorigenesis和Mus musculus。
【采集与来源】
该数据集的来源站为search.dataone.org。实验对象为K-ras小鼠(Mus musculus),处理方式包括油、Corexit 9500、Corexit 9527、9500+油、9527+油以及生理盐水对照。每个处理组包含每种性别3至4只小鼠。对处理后小鼠的肺部进行了RNA-seq。原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO(Gene Expression Omnibus)供公众访问,数据集被分配了GEO访问号GSE148895。
【适用场景】
该数据集适用于与呼吸系统疾病、肺癌、肿瘤发生、石油泄漏相关暴露评估以及分散剂毒性研究等方向相关的分析场景。由于主题标签中明确包含BP oil spill、dispersant、Corexit 9500、Corexit 9527、K-ras mouse、RNA-seq、lung cancer、tumorigenesis和Mus musculus,该数据可用于探索油类与分散剂暴露对小鼠肺部基因表达的影响。本站分类为呼吸系统疾病/其他,提示其可能适用于呼吸系统疾病领域的相关研究。具体适用场景的详细说明源站未提供。
【使用方法】
该数据集的原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO,并分配了GEO访问号GSE148895,用户可通过该访问号在NCBI GEO公共数据库中获取数据。关于数据的具体使用方式、分析流程或推荐工具,源站未提供。
【质量与限制】
每个处理组包含每种性别3至4只小鼠,样本量信息已明确。原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO供公众访问。关于数据质量评估、批次效应、测序深度、覆盖度或其他技术性质量指标,源站未提供。该数据集基于K-ras小鼠模型,其结论向其他物种或人群的外推需谨慎。其他限制信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集被分配了GEO访问号GSE148895,原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO供公众访问。关于引用方式、许可协议或使用条款的具体信息,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本实验中,K-ras小鼠(家鼠)分别接受了油、Corexit 9500、Corexit 9527、9500+油、9527+油以及生理盐水(对照组)的处理。每个处理组包含每种性别3/4只小鼠。对处理后的小鼠肺部进行了RNA-seq。原始RNA-seq数据已提交至NCBI GEO(基因表达综合数据库)供公众访问。该数据集被分配了GEO访问号GSE148895。
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