PRJNA994486：转录组分析揭示高氧诱导急性肺损伤小鼠模型的基因表达变化
该数据集来自 NCBI，包含高氧诱导急性肺损伤（HALI）小鼠模型与野生型对照的 RNA-seq 基因表达数据，用于比较分析 HALI 与对照小鼠的基因表达谱差异
基本信息
资源简介
PRJNA994486：转录组分析揭示高氧诱导急性肺损伤小鼠模型的基因表达变化
PRJNA994486 数据集聚焦于高氧诱导急性肺损伤（HALI）小鼠模型的转录组分析，通过 RNA-seq 技术对 HALI 小鼠与野生型对照小鼠的基因表达模式进行测序，旨在比较分析两者之间的基因表达谱差异。该数据集来源于 NCBI，主题标签为转录组或基因表达，本站将其归类于呼吸系统疾病下的其他类别。高氧治疗是 ICU 危重患者救治的重要手段，但高氧也可能对包括肺在内的多个器官造成损伤，进而引发 HALI——一种轻型急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。该数据集为探索 HALI 发生发展过程中的基因表达变化提供了直接的转录组数据基础，有助于研究者从基因表达层面比较 HALI 与对照小鼠的差异，进而为理解其发病机制与调控机制提供线索。
【数据集背景】
氧疗是 ICU 危重患者救治中不可或缺的手段，但高氧暴露可对多个器官造成损伤，肺是受累器官之一，由此可导致高氧诱导急性肺损伤（HALI），其属于急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的一种轻型表现。然而，HALI 发生发展所涉及的完整发病机制与调控机制目前仍不清楚。为从基因表达层面探究这一问题，相关研究构建了高氧处理的小鼠模型，并对 HALI 小鼠与相应对照小鼠的基因表达模式进行了 RNA-seq 测序，形成了本数据集。该数据集的主题标签为转录组或基因表达，本站分类为呼吸系统疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对 HALI 小鼠模型与野生型对照小鼠开展的 RNA-seq 基因表达数据。按照源站描述，研究进行了 HALI 小鼠与相应对照（relative control）的基因表达模式测序，总体设计为对 HALI 与野生型小鼠的 RNA-seq 数据进行比较性基因表达谱分析。因此，数据集所承载的信息类型为转录组或基因表达层面的数据，其用途在于支撑 HALI 与野生型小鼠之间基因表达谱差异的比较分析。关于样本数量、测序平台、数据文件格式与规模等具体细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），数据集英文名称为“PRJNA994486: Transcriptome Analysis Reveals Gene Expression Changes in a mouse Model of Hyperoxia-induced acute lung injury”。其数据产生方式为：对高氧处理的小鼠模型以及相应对照小鼠进行 RNA-seq 测序，获得基因表达模式数据。研究背景中明确，氧疗对 ICU 危重患者的救治至关重要，而高氧可损伤包括肺在内的多个器官并导致 HALI，这构成了该数据采集的生物学与临床问题背景。关于具体的动物品系、高氧暴露条件、测序建库与测序平台等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
基于源站描述，该数据集适用于以下方向：对 HALI 小鼠与野生型对照小鼠进行基因表达谱的比较分析；从转录组层面考察高氧诱导急性肺损伤相关的基因表达变化；为探究 HALI 的发病机制与调控机制提供基因表达数据支撑。由于 HALI 被视为 ARDS 的一种轻型类型，该数据集也可用于围绕 ARDS 相关肺损伤机制开展的转录组比较研究。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
按照源站的总体设计，该数据集的使用方式为对 HALI 与野生型小鼠的 RNA-seq 数据进行对比性基因表达谱分析，即通过比较两组小鼠的基因表达模式来识别表达差异。关于数据下载方式、预处理流程、分析工具与参数设置等具体使用方法，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于小鼠模型的高氧处理与 RNA-seq 测序，其研究结论定位于动物模型层面的基因表达比较分析，源站描述中将 HALI 界定为 ARDS 的轻型类型，但未提供将该模型结果外推至人类临床的具体说明。关于样本量、重复设置、测序深度、数据质控指标等质量相关信息，源站未提供。使用时应以源站提供的原始描述为准，注意其比较性分析的设计定位。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI，数据集标识为 PRJNA994486。关于引用方式、许可条款与使用限制等具体信息，源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA994486
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
氧气治疗对于ICU危重患者的救治至关重要，但高氧可导致包括肺在内的多器官损伤，引发高氧急性肺损伤（HALI），这是一种轻型急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。然而，HALI发生发展的完整发病机制和调控机制仍不清楚。本研究建立了高氧处理小鼠模型，并对HALI小鼠及相关对照的基因表达模式进行了测序（RNA-seq）。总体设计：对HALI小鼠和野生型小鼠的RNA-seq数据进行比较基因表达谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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