脓毒症分泌G6PD支持鸟嘌呤生成与组蛋白H3K27去甲基化驱动炎性巨噬细胞

该数据集来自NCBI,包含C57BL/6小鼠肺组织的RNA-seq比较基因表达谱分析,涉及Sham、CLP(盲肠结扎穿刺)及CLP+GW三组

sra
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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA962065: Sepsis-secreted G6PD supports guanine generation and Histone H3K27 demethylation to drive inflammatory macrophages

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

脓毒症分泌G6PD支持鸟嘌呤生成与组蛋白H3K27去甲基化驱动炎性巨噬细胞

该数据集来自NCBI,包含C57BL/6小鼠肺组织的RNA-seq比较基因表达谱分析,涉及Sham、CLP(盲肠结扎穿刺)及CLP+GW三组。研究聚焦脓毒症来源细胞外囊泡包裹的G6PD通过重编程嘌呤代谢诱导肺组织促炎效应,并揭示鸟嘌呤积累影响EZH2介导的H3K27Me3水平,最终导致急性肺损伤。数据可用于脓毒症相关急性呼吸窘迫综合征的转录组差异表达与通路分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):脓毒症是一种复杂的综合征,与感染引起的生理、病理和生化异常相关。脓毒症是急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的主要原因。细胞外囊泡(EVs)作为体内介导细胞间通讯的新信使。EVs在脓毒症患者中的功能尚未明确。我们发现脓毒症EV包裹的G6PD通过重编程嘌呤代谢在肺组织中诱导促炎效应。最值得注意的是,鸟嘌呤积累导致EZH2介导的H3K27Me3水平。最后,我们的研究提供了一种新机制,说明EV如何改变肺组织中的嘌呤代谢并导致急性肺损伤。总体设计:对由Sham、CLP(盲肠结扎穿刺)、CLP+GW建立的C57BL/6肺进行RNA-seq数据的比较基因表达谱分析。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA962065

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症是一种复杂的综合征,与感染所致的生理、病理和生化异常相关。脓毒症是急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的主要病因。细胞外囊泡(EVs)作为新的信使,在体内介导细胞间通讯。EVs在脓毒症患者中的功能尚未明确。我们发现,包裹G6PD的脓毒症EVs通过重编程嘌呤代谢,在肺组织中诱导促炎效应。最值得注意的是,鸟嘌呤蓄积导致EZH2介导的H3K27Me3水平变化。最后,我们的研究提供了一种新机制,阐明EVs如何重编程肺组织中的嘌呤代谢并导致急性肺损伤。总体设计:对由Sham、CLP(盲肠结扎穿孔)和CLP+GW建立的C57BL/6肺组织的RNA-seq数据进行比较基因表达谱分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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