PRJNA95073:小鼠呼吸机诱导肺损伤实验

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,为 BALB/c 小鼠呼吸机诱导肺损伤实验的基因表达分析数据,覆盖对照(低压通气)、S. suis LPS 处理、高压通气以及 LPS+高压通气四种处理条件下的肺组织样本

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA95073: Mouse ventilator-induced lung injury experiment

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA95073:小鼠呼吸机诱导肺损伤实验

PRJNA95073 是一个聚焦呼吸机诱导肺损伤(VILI)的小鼠基因表达数据集,来源于 ncbi.nlm.nih.gov,在本站归入呼吸系统疾病 / 其他类别。该数据集以 BALB/c 小鼠为实验对象,对肺组织进行基因表达分析,覆盖对照(低压通气)、S. suis LPS 处理、高压通气以及 LPS+高压通气四种处理条件,主题标签为 Transcriptome or Gene expression。整体设计围绕 VILI、基因表达谱分析与 ARDS 展开,可用于观察不同通气压力与脂多糖刺激单独或联合作用下肺组织转录水平的变化,为理解机械通气相关肺损伤的分子响应提供数据基础。

【数据集背景】

呼吸机诱导肺损伤是机械通气过程中可能出现的重要问题,与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的病理过程密切相关。该数据集正是针对这一背景设计的小鼠实验,通过设置低压通气对照、S. suis LPS 处理、高压通气以及 LPS 与高压通气联合处理等条件,模拟不同刺激因素对肺组织基因表达的影响,从而为 VILI 及 ARDS 相关机制研究提供转录组层面的观察材料。

【数据内容】

数据集的核心内容是 BALB/c 小鼠肺组织的基因表达分析数据,主题标签为 Transcriptome or Gene expression。实验分组包括对照(C,低压通气)、S. suis LPS 处理(LPS)、高压通气(OV)以及 LPS+高压通气(OVLPS)四组。数据所反映的是在上述不同处理条件下肺组织的基因表达谱,可用于比较各组之间转录水平的差异。除上述分组与表达分析性质外,源站未提供关于样本数量、检测平台、具体基因列表或差异表达阈值的进一步信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA95073: Mouse ventilator-induced lung injury experiment。实验对象为 BALB/c 小鼠,采集材料为肺组织。源站描述中给出的关键词包括 VILI、gene expression profiling 与 ARDS,整体设计涵盖对照、LPS、高压通气及二者联合处理四种条件。关于具体的采样时间点、通气参数细节、LPS 剂量与给药方式等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病相关研究,尤其是呼吸机诱导肺损伤与 ARDS 方向的基因表达谱分析。研究人员可利用其比较低压通气对照与高压通气、LPS 刺激及联合处理之间的转录组差异,探索机械牵张与炎症刺激在肺组织中的分子响应特征。此外,该数据也可作为转录组或基因表达研究的数据资源,用于方法学验证、候选基因筛选思路的构建以及与同类肺损伤实验数据的对照参考。

【使用方法】

使用时应依据四个处理组的分组信息组织比较分析,例如将高压通气组、LPS 处理组及联合处理组分别与低压通气对照组进行对照,以观察不同处理引起的基因表达变化。由于主题标签为 Transcriptome or Gene expression,分析可围绕表达谱层面的组间比较展开。关于数据的具体文件格式、下载方式、预处理流程与标准化方法,源站未提供,使用前需结合源站页面进一步确认。

【质量与限制】

该数据集为小鼠实验来源的基因表达分析数据,实验分组明确,覆盖对照与三种处理条件,具备较好的组间对照设计。但源站未提供样本量、技术重复、测序或芯片平台、数据质控指标等信息,因而无法据此评估数据的统计效力与噪声水平。此外,实验对象为 BALB/c 小鼠,结果外推到其他物种或人群时需谨慎。上述限制在使用与解读时应予以考虑。

【引用与许可】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA95073: Mouse ventilator-induced lung injury experiment。关于引用方式、作者信息、发表文献及许可条款,源站未提供,使用或再分发前应查阅源站页面获取相应说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA95073

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gene expression analysis of BALB/c mouse lung tissue following LPS, high pressure ventilation and LPS+high pressure ventilation treatment Keywords: VILI, gene expression profiling, ARDS Overall design: BALB/c mice control © (low pressure ventilation), S. suis LPS treatment (LPS), high pressure ventilation (OV) and LPS+OV (OVLPS)

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