PRJNA944147：增强CD11c+抗原呈递细胞自噬治疗急性呼吸窘迫综合征与肺部炎症
该数据集来自NCBI，聚焦呼吸系统疾病中的急性呼吸窘迫综合征与肺部炎症。研究通过Poly(I:C)诱导的小鼠ALI/ARDS模型，构建了在CD11c+抗原呈递细胞中特异性敲除自噬相关基因Atg5以 impair 自噬的小鼠，以及在同细胞中过表达自噬调控因子Tfeb以持续诱导自噬的小鼠
基本信息
资源简介
PRJNA944147：增强CD11c+抗原呈递细胞自噬治疗急性呼吸窘迫综合征与肺部炎症
PRJNA944147 数据集来自 NCBI，聚焦呼吸系统疾病中的急性呼吸窘迫综合征与肺部炎症。该研究围绕自噬在 CD11c+ 抗原呈递细胞中的作用展开，利用 Poly(I:C) 诱导的小鼠 ALI/ARDS 模型，构建了两类动物模型：一类在 CD11c+ 抗原呈递细胞中特异性敲除自噬相关基因 Atg5 以削弱自噬，另一类在同一细胞类型中过表达自噬调控转录因子 Tfeb 以持续诱导自噬。数据集的主题标签为转录组或基因表达，属于呼吸系统疾病分类下的“其他”类别，可为研究自噬调控与急性肺损伤、肺部炎症之间关系提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征（ARDS）和肺部炎症是呼吸系统疾病中危害严重的临床问题，其发病机制涉及多种细胞类型和分子通路。自噬作为细胞内重要的降解与稳态维持机制，在免疫细胞功能调控中受到广泛关注。CD11c+ 抗原呈递细胞包括树突状细胞和部分巨噬细胞群体，在肺部免疫应答和炎症调控中发挥关键作用。该数据集所对应的研究旨在探究自噬在 CD11c+ 抗原呈递细胞中对 Poly(I:C) 诱导的急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征小鼠模型的影响，通过遗传学手段分别削弱和增强该类细胞的自噬水平，从而在转录组层面观察基因表达变化。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据为转录组或基因表达相关数据。研究设计包含两类基因修饰小鼠模型：其一为在 CD11c+ 抗原呈递细胞中特异性敲除自噬相关基因 5（Atg5），从而损害自噬功能；其二为在 CD11c+ 抗原呈递细胞中过表达转录因子 EB（Tfeb），该因子是自噬的调控因子，可实现自噬的持续诱导。数据集应涵盖上述模型在 Poly(I:C) 诱导的 ALI/ARDS 背景下的基因表达信息。关于样本数量、测序平台、具体基因表达矩阵或差异表达结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI，源站地址为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集标识为 PRJNA944147。根据源站描述，研究采用 Poly(I:C) 诱导的小鼠 ALI/ARDS 模型，并在此基础上构建了 Atg5 特异性敲除和 Tfeb 过表达两种 CD11c+ 抗原呈递细胞靶向的基因修饰小鼠。数据采集的具体实验流程、测序平台、样本处理与建库方法等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病研究，尤其是急性呼吸窘迫综合征与肺部炎症相关的基础研究。其转录组或基因表达数据可用于探索 CD11c+ 抗原呈递细胞中自噬水平改变对肺部炎症和急性肺损伤相关基因表达的影响，也可用于比较自噬受损与自噬增强两种状态下基因表达谱的差异。此外，该数据集可为自噬相关基因 Atg5 和转录因子 Tfeb 在免疫细胞中的功能研究提供表达层面的参考。关于数据的具体适用分析类型和验证范围，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI 公共数据平台访问和获取。使用者可根据数据集标识 PRJNA944147 在 NCBI 中检索相关项目信息。由于源站未提供样本分组、测序平台和数据处理流程等细节，具体的数据下载、质控、比对和表达定量步骤需依据 NCBI 平台上的项目页面信息进行。源站未提供针对该数据集的分析指南或推荐参数。
【质量与限制】
该数据集基于 Poly(I:C) 诱导的小鼠 ALI/ARDS 模型，并涉及 CD11c+ 抗原呈递细胞中 Atg5 敲除与 Tfeb 过表达两种基因修饰策略，研究设计具有明确的机制指向性。然而，源站未提供样本量、测序深度、数据质控指标、重复数或统计效力等信息，因此无法对数据质量进行具体评估。数据集分类为呼吸系统疾病下的“其他”，其覆盖范围和数据完整性需结合源站项目页面进一步确认。源站未提供关于数据局限性的专门说明。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，数据集标识为 PRJNA944147。关于该数据集的引用方式、作者信息、发表文献及许可条款，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时，应查阅 NCBI 项目页面上的相关说明并遵循 NCBI 的数据使用政策。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA944147
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为探究自噬在Poly(I:C)诱导的ALI/ARDS小鼠模型CD11c+抗原提呈细胞（APC）中的作用，总体设计如下：我们构建了两种动物模型；一种是在CD11c+ APC中特异性敲除自噬相关基因5（Atg5）以损害自噬的小鼠，另一种是在CD11c+ APC中过表达自噬调节因子转录因子EB（Tfeb）以持续诱导自噬的小鼠。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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