基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA928385：儿童ARDS存活肺修复的转录组证据

PRJNA928385 数据集聚焦儿童急性呼吸窘迫综合征（ARDS）存活者的肺组织与外周血细胞转录组特征。儿童ARDS患者的存活情况优于成人，但其肺组织与外周循环的免疫学特征此前尚不明确。该数据集来源于NCBI，记录了一名10岁女孩在抗感染、抗炎治疗及ECMO支持下从ARDS中恢复的过程，期间通过手术修复了气漏，并采集手术切除的肺活检组织与外周血细胞（PBCs），连同其他对照受试者样本一起进行单细胞RNA测序分析，同时对肺活检组织开展了病理检查。数据揭示了ARDS恢复期外周血细胞与肺部微环境的转录特征，提示高效供氧、适当的免疫调节和充分的抗感染治疗有利于儿童从ARDS中恢复。数据集归类于呼吸系统疾病，主题标签为转录组或基因表达。

【数据集背景】

急性呼吸窘迫综合征是一种严重的呼吸系统疾病，儿童患者的存活率高于成人，但其肺组织与外周循环的免疫学特征长期缺乏系统刻画。该数据集正是针对这一空白而产生：通过对一名10岁ARDS存活患儿的肺活检组织与外周血细胞进行单细胞RNA测序，并结合对照受试者样本，从转录组层面描述ARDS恢复期的肺部微环境与外周血细胞特征，为理解儿童ARDS恢复的免疫学基础提供数据支撑。

【数据内容】

数据集的核心内容是单细胞RNA测序数据，测序对象包括来自该10岁ARDS患儿的肺活检组织与外周血细胞（PBCs），以及来自其他对照受试者的相应样本。除测序数据外，数据集还包含对肺活检组织进行的病理检查结果。主题标签为转录组或基因表达，表明数据主体反映的是基因表达层面的信息。源站描述在“Overall design”处截断，未提供完整的研究设计细节。

【采集与来源】

样本采集自一名10岁女孩，她因ARDS接受抗感染、抗炎方案治疗并接受ECMO支持，期间通过手术修复了气漏；手术切除的肺活检组织与外周血细胞被用于单细胞RNA测序分析，对照受试者亦提供了相应样本。数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为“PRJNA928385: Transcriptomic evidence of lung repair in paediatric ARDS survival”。

【适用场景】

该数据集适用于研究儿童ARDS恢复期的转录组特征，包括肺组织微环境与外周血细胞的基因表达谱分析；也可用于比较ARDS患者与对照受试者之间的表达差异，探讨高效供氧、免疫调节与抗感染治疗背景下儿童ARDS恢复的相关生物学线索。主题标签指向转录组或基因表达，因此适合基因表达相关分析场景。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。需注意源站描述在“Overall design”处截断，研究设计的完整信息不完整；数据集基于单名ARDS患儿及对照受试者，样本规模信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE223793

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA928385

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

儿科急性呼吸窘迫综合征（ARDS）患者的存活率优于成人。然而，儿科ARDS中肺组织和外周循环的免疫学特征尚不明确。一名10岁女孩患有ARDS，接受了抗感染、抗炎方案治疗及ECMO支持。气漏通过手术修复。从该患者及其他对照受试者中获取手术切除的肺活检组织和外周血细胞（PBCs），用于单细胞RNA测序分析。同时对肺活检组织进行了病理学检查。我们的数据揭示了ARDS恢复期PBCs和肺微环境的转录特征，并指出高效供氧、适当的免疫调节和充分的抗感染治疗有利于儿童从ARDS中恢复。总体设计：收集肺组织和外周血样本进行单细胞转录组分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别