PRJNA680616：DISARM 研究——吸入性糖皮质激素对 COPD 支气管上皮细胞基因表达的影响
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 680616），对应 DISARM 研究，主题为吸入性糖皮质激素对 COPD 患者支气管上皮细胞基因表达的影响
基本信息
资源简介
PRJNA680616：DISARM 研究——吸入性糖皮质激素对 COPD 支气管上皮细胞基因表达的影响
PRJNA680616 是 NCBI BioProject 数据库中收录的一项生物研究项目，其英文全称为 The DISARM study: effects of inhaled corticosteroids on bronchial epithelial cell gene expression in COPD。该数据集围绕慢性阻塞性肺疾病（COPD）展开，聚焦于吸入性糖皮质激素对支气管上皮细胞基因表达所产生的影响。从主题标签来看，该项目属于转录组或基因表达研究范畴，归类于呼吸系统疾病领域。作为 BioProject 体系中的一条记录，它汇集了与 DISARM 研究相关的生物学数据，为使用者提供了一个统一的入口，用以查找和访问该项目所产生的多种数据类型。整体而言，该数据集适合关注 COPD 治疗机制、吸入性糖皮质激素药理作用以及呼吸道上皮细胞转录组变化的研究人员参考使用。
【数据集背景】
该数据集对应的研究名称为 DISARM 研究，全称指向吸入性糖皮质激素对 COPD 患者支气管上皮细胞基因表达的影响。慢性阻塞性肺疾病是一种以持续气流受限为特征的呼吸系统疾病，而吸入性糖皮质激素是临床上用于控制气道炎症的常见治疗手段之一。DISARM 研究正是围绕这一治疗干预与气道细胞基因表达之间的关系展开。该记录归属于 NCBI BioProject，项目编号为 680616。BioProject 作为一个生物数据集合，通常来源于单一机构或联合体，旨在为某一项研究计划提供集中式的数据链接入口。源站描述指出，BioProject 记录使用户能够在同一处找到该项目所生成的不同类型数据的链接，因此该数据集在结构上属于项目级别的元数据记录，而非单一实验的原始数据文件。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据与转录组或基因表达相关。结合研究标题可知，数据内容应涉及支气管上皮细胞在吸入性糖皮质激素作用下的基因表达信息。然而，关于具体的样本数量、测序平台、基因列表、表达量矩阵、差异表达分析结果等详细内容，源站未提供。该 BioProject 记录本身主要起到汇集和索引作用，具体的数据文件类型、数据量大小以及数据组织方式，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，即美国国家生物技术信息中心（NCBI）的 BioProject 数据库。项目编号为 PRJNA680616，源站标题显示为 The DISARM study: effects of inhaled corticosteroi... (ID 680616) - BioProject - NCBI。关于样本采集的具体地点、时间、受试者纳入标准、伦理审批信息、实验操作流程以及测序或检测方法等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是 COPD 相关的基础与临床转化研究。研究人员可利用该数据集探索吸入性糖皮质激素对支气管上皮细胞转录组的影响，进而分析药物响应相关的基因表达变化。此外，该数据集也可用于转录组数据的二次分析、生物信息学方法验证，或作为 COPD 基因表达研究的参考项目之一。由于该记录属于 BioProject 层级，使用者可以通过它定位到关联的原始数据或衍生数据，从而支持更广泛的气道炎症与糖皮质激素机制研究。但具体适用场景需结合源站提供的实际数据内容加以判断，源站未提供详细的使用建议。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA680616 或标题关键词进行检索，访问该项目的记录页面。BioProject 记录通常提供指向不同数据类型的链接，用户可据此跳转至相应的数据存储库获取原始或处理后的数据。关于数据下载格式、分析工具推荐、预处理步骤或代码示例等具体操作指引，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库收录的项目记录，其数据质量依赖于原始研究的设计与执行。由于源站未提供样本量、测序深度、重复次数、质控指标等具体信息，无法对该数据集的数据质量进行量化评估。此外，该记录为项目级描述，可能不包含完整的实验细节或分析结果，使用者在解释和再利用数据时需注意这一限制。其他潜在限制，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权声明，源站未提供。使用者在使用相关数据时，应自行查阅 NCBI BioProject 页面及关联数据存储库中可能列出的引用要求和许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA680616
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
吸入型Symbicort与AdvaiR对肺部微生物群的差异效应（DISARM）研究旨在确定吸入型皮质类固醇（ICS）对肺部微生物组的影响。完整试验方案已在clinicaltrials.gov注册（NCT02833480），该研究获得了不列颠哥伦比亚大学人类研究伦理委员会及普罗维登斯医疗保健机构（H14-02277）的批准。参与者被随机分配接受吸入型长效β受体激动剂（LABA）治疗，使用福莫特罗，或接受LABA/ICS联合治疗，使用福莫特罗/布地奈德或沙美特罗/氟替卡松丙酸酯，为期12周。治疗前后进行了支气管镜检查，并收集了支气管肺泡灌洗液和支气管刷检样本（第6-8代）。本数据集包含来自支气管刷检样本的RNA-seq数据。按照制造商的说明，使用RNeasy Plus试剂盒（QIAGEN）从储存在QIAzol RNA裂解缓冲液（QIAGEN，德国施托卡赫）中的细胞学刷检样本中提取RNA，并将样本提交至不列颠哥伦比亚大学生物医学研究中心进行测序。
使用Agilent 2100 Bioanalyzer（Agilent，Santa Clara，CA，USA）进行样本质量控制。合格样本随后按照NEBnext Ultra ii Stranded mRNA（New England Biolabs，Ipswich，MA，USA）的标准方案进行制备。测序在Illumina NextSeq 500（Illumina，San Diego，CA，USA）上进行，采用双端42bp × 42bp读长。样本按24个一批进行测序，批次通过随机选择样本形成。总体设计：随机对照试验。由于治疗期间存在COPD急性加重的风险，DISARM试验未纳入安慰剂组。FOR单药治疗被视为对照组。63名轻至极重度COPD参与者被随机分为3组：FOR（n=21）、FOR/BUD（20）或SAL/FLU（n=22）。61名参与者有可用的治疗前测序数据，
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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