PRJNA674855：重组抗凝血酶治疗内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）
该数据集来自 NCBI，围绕内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）小鼠模型，研究重组抗凝血酶（rAT）对 ARDS 的作用
基本信息
资源简介
PRJNA674855：重组抗凝血酶治疗内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）
PRJNA674855 数据集来自 NCBI，围绕内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）小鼠模型，评估重组抗凝血酶（rAT）对 ARDS 的作用。研究以脂多糖（LPS）诱导建立 ARDS 模型，并在部分实验中给予生理盐水或重组抗凝血酶干预，随后采集小鼠肺组织提取总 RNA，用于转录组或基因表达分析。该数据集为研究 ARDS 发病机制及重组抗凝血酶干预后的肺部基因表达变化提供了原始数据基础，属于呼吸系统疾病领域的转录组数据资源。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是临床常见的危重呼吸系统疾病，内毒素血症是其重要诱因之一。该数据集对应的研究旨在通过 LPS 诱导的小鼠 ARDS 模型，考察重组抗凝血酶（rAT）对 ARDS 的作用。研究设计包含 LPS 造模以及生理盐水或重组抗凝血酶干预分组，通过在 LPS 注射后不同时间点给药，观察干预对肺部基因表达的影响，从而为理解 rAT 在 ARDS 中的潜在作用提供转录组层面的证据。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，即转录组或基因表达数据。数据来源于小鼠肺组织，实验在 LPS 注射后 30 小时提取肺组织总 RNA，用于后续基因表达检测。数据集整体设计为：小鼠经 16 小时禁食后腹腔注射 LPS（20 mg/kg；MilliporeSigma, Burlington, MA），部分实验在 LPS 注射后 3 小时和 24 小时给予生理盐水或重组抗凝血酶（rAT；750 IU/kg；Kyowa Kirin Co., Ltd, Tokyo, Japan）。数据内容围绕上述处理条件下小鼠肺组织的基因表达谱展开。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。样本采集流程为：小鼠禁食 16 小时后腹腔注射 LPS 建立内毒素血症诱导的 ARDS 模型，并在指定时间点给予生理盐水或重组抗凝血酶；LPS 注射后 30 小时取小鼠肺组织，提取总 RNA。数据所属分类为呼吸系统疾病 / 其他，主题为转录组或基因表达。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是 ARDS 相关研究，可用于分析内毒素血症诱导 ARDS 小鼠模型肺组织的基因表达变化，比较重组抗凝血酶干预与对照条件下的转录组差异，探索 rAT 对 ARDS 作用的分子机制。也可作为转录组或基因表达研究的参考数据，用于相关实验设计的借鉴与结果对照。
【使用方法】
源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA674855
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们建立了LPS诱导的ARDS模型小鼠，并测定了重组抗凝血酶对ARDS的作用。总体设计：禁食16小时后，小鼠腹腔注射LPS（20 mg/kg；MilliporeSigma，Burlington，MA），在某些实验中，于LPS注射后3小时和24小时注射生理盐水或重组抗凝血酶（rAT；750 IU/kg；Kyowa Kirin Co., Ltd，Tokyo，Japan）。LPS注射后30小时从小鼠肺中提取总RNA。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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