PRJNA539896：重组人血栓调节蛋白治疗内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）
该数据集来自NCBI，围绕LPS诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）小鼠模型，研究重组人血栓调节蛋白（rhTM）对ARDS的作用
基本信息
资源简介
PRJNA539896：重组人血栓调节蛋白治疗内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）
PRJNA539896 数据集聚焦于内毒素血症诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的转录组研究，采用 LPS 诱导的 ARDS 小鼠模型，考察重组人血栓调节蛋白（rhTM）对该疾病的作用。数据集来源于 NCBI，归类于呼吸系统疾病 / 其他，主题标签为转录组或基因表达。整体设计围绕在 LPS 注射后给予生理盐水或 rhTM，并于 LPS 注射后 30 小时采集小鼠肺组织提取总 RNA，用于基因表达层面的分析。该数据集可用于了解 ARDS 模型下肺部转录组变化及 rhTM 干预相关的基因表达特征。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是一种严重的呼吸系统疾病，内毒素血症是其重要诱因之一。该数据集针对内毒素血症诱导的 ARDS，采用 LPS 诱导的小鼠模型，研究重组人血栓调节蛋白（rhTM）对 ARDS 的治疗作用。源站描述指出，研究者制作了 LPS 诱导的 ARDS 模型小鼠，并测定 rhTM 对 ARDS 的效果。这一背景说明数据集服务于 ARDS 发病机制及潜在治疗干预的转录组层面探索。
【数据内容】
该数据集的主题标签为转录组或基因表达，说明其核心数据为基因表达相关信息。源站描述显示，研究从小鼠肺部提取总 RNA，采样时间为 LPS 注射后 30 小时。整体设计包括 LPS 注射，以及在部分实验中于 LPS 注射后 3 小时和 24 小时给予生理盐水或重组人血栓调节蛋白（rhTM）。数据内容围绕这些处理条件下小鼠肺组织的转录组或基因表达谱展开。关于具体样本数量、测序平台、数据文件类型与规模等信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述给出了实验采集流程：小鼠经过 16 小时禁食后，腹腔注射 LPS（20 mg/kg；MilliporeSigma, Burlington, MA），并在部分实验中于 LPS 注射后 3 小时和 24 小时注射生理盐水或重组人血栓调节蛋白（rhTM；Asahi Kasei Pharma Corporation, Tokyo, Japan）。LPS 注射后 30 小时从小鼠肺组织提取总 RNA。上述信息构成了该数据集样本采集与实验来源的基本说明。更详细的动物品系、伦理审批及测序建库信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病特别是 ARDS 相关的转录组或基因表达研究场景。由于实验设计包含 LPS 诱导的 ARDS 模型以及 rhTM 干预，可用于比较不同处理条件下小鼠肺组织的基因表达特征，探索 rhTM 对 ARDS 的作用所涉及的表达变化。其主题标签表明数据可用于转录组或基因表达分析类研究。具体可支持的统计比较组别、差异表达分析设计等细节，源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时，可依据源站描述理解实验分组与采样时间点：LPS 注射后 3 小时和 24 小时给予生理盐水或 rhTM，LPS 注射后 30 小时采集肺组织提取总 RNA。研究者可据此在转录组或基因表达层面开展分析。关于数据下载方式、文件格式、预处理流程及分析工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 LPS 诱导的小鼠 ARDS 模型，实验描述涉及禁食、LPS 腹腔注射、生理盐水或 rhTM 给药以及肺组织总 RNA 提取等关键环节。源站描述未提供样本量、重复数、测序深度、数据质控指标等信息，因此无法据此评估数据质量。该数据集为小鼠模型研究，向人类临床的转化需谨慎。其他质量与限制相关信息，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来自 NCBI，英文名称为 PRJNA539896: Recombinant humant thrombomodulin treatment against endotoxemia-induced acute respiratory distress syndrome (ARDS).。关于引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA539896
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们建立了LPS诱导的ARDS模型小鼠，并测定了重组人血栓调节蛋白对ARDS的作用。总体设计：禁食16小时后，小鼠腹腔注射LPS（20 mg/kg；MilliporeSigma，Burlington，MA），在部分实验中，于LPS注射后3小时和24小时注射生理盐水或重组人血栓调节蛋白（rhTM；Asahi Kasei Pharma Corporation，东京，日本）。LPS注射后30小时从小鼠肺中提取总RNA。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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