PRJNA475222：EHP-101治疗博来霉素诱导硬皮病小鼠模型皮肤的RNA-Seq分析
数据内容为博来霉素诱导的硬皮病小鼠模型经EHP-101治疗后皮肤组织的RNA-Seq分析，可用于研究该疾病模型下皮肤转录组或基因表达变化
基本信息
资源简介
PRJNA475222：EHP-101治疗博来霉素诱导硬皮病小鼠模型皮肤的RNA-Seq分析
PRJNA475222 是一个围绕博来霉素诱导的硬皮病小鼠模型、并考察 EHP-101 治疗效果的皮肤组织 RNA-Seq 分析项目。该项目以转录组或基因表达为主题，数据内容聚焦于该疾病模型下皮肤组织的基因表达变化，可用于研究硬皮病相关皮肤转录组特征以及 EHP-101 干预后的表达谱改变。项目由 NCBI BioProject 收录，编号为 475222，属于呼吸系统疾病 / 其他分类下的生物项目资源。整体而言，该数据集为研究者提供了一个针对特定小鼠模型与特定治疗条件的皮肤转录组数据入口，便于进一步探索疾病机制与治疗响应。
【数据集背景】
硬皮病是一种以皮肤及内脏器官纤维化为特征的疾病，博来霉素诱导的小鼠模型常被用于模拟其部分病理过程。EHP-101 是该研究中使用的治疗干预。该 BioProject 记录来源于 NCBI，旨在汇集与单一研究计划相关的生物数据，使用户能够在一个位置找到该项目产生的多种数据类型。项目标题明确指向“博来霉素诱导的硬皮病小鼠模型经 EHP-101 治疗后皮肤组织的 RNA-Seq 分析”，说明其核心背景是围绕该疾病模型与治疗条件下的皮肤转录组研究。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。具体而言，数据为博来霉素诱导的硬皮病小鼠模型经 EHP-101 治疗后皮肤组织的 RNA-Seq 分析结果。RNA-Seq 是一种用于检测和定量转录本表达的高通量测序技术，因此该项目产生的数据可用于研究该疾病模型下皮肤转录组或基因表达变化。数据可能包括测序读段、表达定量结果等与基因表达相关的信息，但源站未提供更细粒度的文件类型或数据表说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目编号为 475222。BioProject 作为生物数据的集合，通常来自单一组织或联盟，并围绕一个统一的研究计划组织。该记录本身提供的是项目层面的入口信息，而非直接的分析结果或样本元数据。关于样本采集的具体时间、地点、小鼠品系、处理剂量、测序平台等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究博来霉素诱导的硬皮病小鼠模型下皮肤组织的转录组或基因表达变化，也可用于探索 EHP-101 治疗对该模型皮肤基因表达谱的影响。潜在应用包括：比较治疗组与对照组之间的差异表达基因、分析纤维化相关通路、寻找潜在生物标志物，或作为更广泛硬皮病研究中的转录组参考数据。由于项目分类为呼吸系统疾病 / 其他，也可能与呼吸系统疾病背景下的纤维化或炎症研究产生关联，但源站未提供具体关联说明。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录编号 475222 访问该项目页面，并利用 BioProject 提供的链接查找该项目生成的不同数据类型。由于 BioProject 是项目层面的集合，实际数据可能分布在 NCBI 的其他相关数据库或资源中。具体的数据下载方式、分析流程、软件工具和参数设置，源站未提供。使用者应根据自身研究目的，结合项目标题和主题标签，判断数据是否适用于皮肤转录组或基因表达分析。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，提供的是项目层面的描述与链接，而非经过统一质量控制的分析结果。关于测序深度、重复数、样本量、数据完整性、批次效应等质量指标，源站未提供。此外，该数据基于博来霉素诱导的小鼠模型和 EHP-101 治疗条件，其结果向其他物种、其他硬皮病模型或其他治疗条件的推广需谨慎。源站未提供具体的限制说明或质量评估信息。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可条款和使用限制，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 页面上的相关声明，并遵循 NCBI 的通用数据使用政策。由于源站未提供具体的引用格式或授权信息，建议直接访问项目页面获取最新说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA475222
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
系统性硬化症（SSc）或硬皮病是一种病因不明的慢性多器官自身免疫性疾病，以血管、免疫和纤维化异常为特征。多项证据表明，内源性大麻素系统（ECS）可能在SSc的病理生理学中发挥作用。VCE-004.8是一种CBD氨基醌衍生物，为PPARγ/CB2双重激动剂，可减轻博来霉素（BLM）诱导的皮肤纤维化。本文中我们报道，EHP-101——VCE-004.8的口服脂质制剂——可预防BLM诱导小鼠的皮肤和肺纤维化及胶原积累。皮肤免疫组化分析表明，EHP-101可阻止巨噬细胞浸润，以及Tenascin C（TNC）、VCAM和α-平滑肌肌动蛋白（SMA）的表达。此外，与皮肤纤维化相伴的血管CD31表达减少也被EHP-101所阻止。皮肤活检的RNAseq分析显示，EHP-101对炎症性和上皮-间充质转化转录组特征具有明显影响。
在BLM小鼠中，TGF-beta调控的基因如基质金属蛋白酶-3（Mmp3）、细胞色素b-245重链（Cybb）、淋巴细胞抗原6E（Ly6e）、血管细胞粘附分子-1（Vcam1）和整合素α-5（Itga5）被诱导，而EHP-101治疗则抑制了这些基因的表达。我们还将EHP-101治疗小鼠的差异表达基因与人类硬皮病内在基因数据集进行了交集分析，发现了53个重叠基因，包括C-C模体趋化因子2（Ccl2）和白介素13受体亚单位α1（IL-13Ra1）基因，这些基因已被研究作为SSc的生物标志物。总之，这些结果表明，这种合成大麻素有望成为管理和可能治疗硬皮病以及潜在其他纤维化疾病的新型化合物。总体设计：针对六至八周龄的雌性BALB/c小鼠，在三种条件下——对照组、博来霉素组和博来霉素+EHP-101治疗组（N=2）——生成了RNA-Seq图谱。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
