PRJNA314888：急性移植物抗宿主病Act-mOVA/OT-I模型中CD8+ T细胞应答

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA314888

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

接受致死剂量照射的C57Bl/6 Act-mOVA小鼠在接受来自C57Bl/6 OT-I动物的异基因造血干细胞移植（aHSCT）后，以CD8+ T细胞依赖的方式可重复地发生急性移植物抗宿主病（aGvHD），并在4-7天内死于该病。对UBC-GFP/OT-I移植物CD8+ T细胞的追踪显示，在疾病发作时胃肠道、肝脏和肺部存在大量浸润，并具有急性胃肠道和肝脏GvHD以及aGVHD相关淋巴细胞性支气管炎的标志性组织学特征。本数据集描述了从移植前（aHSCT + 第0天）的移植物中，以及将细胞移植入Act-mOVA受体后（aHSCT + 第4天）从宿主各靶器官中回收的CD45.1/OT-1 CD8+ T细胞的基因表达模式。总体设计：通过aHSCT在健康的8-16周龄C57Bl/6 m-act OVA雌性小鼠中诱导致死性急性移植物抗宿主病。受体Act-mOVA小鼠接受全身照射（11Gy，分两次剂量），并移植来自8-16周龄C57Bl/6 OT-I供体小鼠的3x10E+6异基因骨髓细胞和1.5x10E+7脾细胞。

移植的OT-I CD8+ T细胞取自CD45.1动物，而所有其他移植细胞和受体均携带CD45.2等位基因。对于微阵列实验，在移植当天，通过携带CD45.1特异性抗体的磁珠从移植物中收集移植的初始CD45.1 CD8+ OT-I T细胞作为对照。aHSCT后四天，同样通过该方法从表现出急性GVHD的Act-mOVA小鼠的肝脏、肺和小肠解离组织样本中回收移植的CD45.1 CD8+ OT-I T细胞，并进一步通过全基因组基因表达谱分析进行分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。