同种异体人间充质干细胞与人肺泡II型上皮细胞原代培养的表达数据

该数据集来自 NCBI,包含同种异体人骨髓来源间充质干细胞(MSCs)与人肺泡II型上皮细胞原代培养的表达数据,主题为转录组或基因表达

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA283317: Expression Data from  Allogeneic Human Mesenchymal Stem Cells and Primary Cultures of Human Alveolar Epithelial Type II Cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

同种异体人间充质干细胞与人肺泡II型上皮细胞原代培养的表达数据

该数据集来自 NCBI,包含同种异体人骨髓来源间充质干细胞(MSCs)与人肺泡II型上皮细胞原代培养的表达数据,主题为转录组或基因表达。源站描述指出研究聚焦急性肺损伤(ALI)与急性呼吸窘迫综合征(ARDS),拟在促炎细胞因子诱导的体外急性肺损伤模型中检验人 MSCs 的治疗价值,并鉴定原代培养细胞中的差异表达基因。数据可用于分析 MSCs 旁分泌因子对肺上皮通透性的调控及相关基因表达变化(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):急性肺损伤(ALI)或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)是一种严重综合征,在美国每年影响超过200,000名患者。需要新的研究来理解损害肺泡上皮功能的生物学和临床机制。此外,还需要创新疗法来解决ARDS中的肺水肿。我们和其他研究者已报道,骨髓来源间充质干细胞(MSCs)在ALI的临床前模型中有效,因为它们能够分泌多种旁分泌因子,这些因子可以调节肺内皮和上皮通透性,包括生长因子、抗炎细胞因子和抗菌肽。因此,在本研究中,我们将在由促炎细胞因子诱导的急性肺损伤体外模型中测试人MSCs的治疗价值。我们将鉴定原代

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA283317

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性肺损伤(ALI)或急性呼吸窘迫综合征(ARDS)是一种严重综合征,在美国每年影响超过20万名患者。需要新的研究来理解损害肺泡上皮功能的生物学和临床机制。此外,还需要创新疗法来解决ARDS中的肺水肿。我们和其他研究者已报道,骨髓来源的间充质干细胞(MSCs)在ALI的临床前模型中有效,因为它们能够分泌多种旁分泌因子,这些因子可调节肺内皮和上皮通透性,包括生长因子、抗炎细胞因子和抗菌肽。因此,在本研究中,我们将在由促炎细胞因子诱导的急性肺损伤体外模型中测试人MSCs的治疗价值。我们将使用Affymetrix基因表达芯片鉴定人肺泡上皮II型细胞原代培养物和人骨髓来源间充质干细胞中的差异表达基因。总体设计:人间充质干细胞(MSCs)与人肺泡上皮II型细胞在Transwell系统中共同培养。

细胞在不同条件下用cytomix(多种促炎细胞因子的组合)刺激。收集细胞用于Affymetrix基因表达芯片分析。共分析了25个样本,包括3~5个重复。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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