基本信息

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创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA266547：与肺气肿相关的基因富集于泛素化通路

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 266547，英文名称为“PRJNA266547: Genes related to emphysema are enriched for ubiquitination pathways”，源站标题为“Homo sapiens (ID 266547) - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，在本站分类中归入呼吸系统疾病 / 其他。从名称与主题可以看出，该数据集围绕人类（Homo sapiens）肺气肿相关基因在泛素化通路中的富集情况展开，属于转录组或基因表达范畴的生物学项目数据集合。BioProject 作为单一研究计划相关生物学数据的汇集记录，为用户提供指向该项目所产生多种数据类型的统一入口，因此该数据集可作为查找和关联肺气肿泛素化通路基因表达研究相关数据的起点。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 266547，物种为 Homo sapiens。其英文名称明确指向“与肺气肿相关的基因在泛素化通路中富集”这一研究主题。BioProject 记录本身是围绕单一研究计划、由单一组织或联盟发起而汇集的一组生物学数据，旨在为用户提供一个统一位置，以便找到该项目所产生的多种数据类型之间的链接。因此，该数据集的背景是一项以人类为对象、关注肺气肿相关基因与泛素化通路关系的转录组或基因表达研究项目。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达类型。项目名称进一步提示，数据内容与肺气肿相关基因在泛素化通路中的富集分析有关。关于具体的样本数量、测序平台、数据文件格式、基因列表或分析结果等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 266547) - BioProject - NCBI”，项目编号 266547。其采集对象为人类（Homo sapiens）相关生物学数据，归属于 BioProject 体系。关于具体的采集方法、采样地点、时间范围或实验设计等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病特别是肺气肿相关基因表达与泛素化通路富集研究的数据查找与关联。由于主题标签为转录组或基因表达，可用于寻找该 BioProject 下产生的基因表达类数据入口。关于更具体的适用分析场景或应用案例，源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 266547）进行访问，BioProject 记录提供指向该项目所产生多种数据类型的链接，用户可据此定位相关数据。关于具体的数据下载方式、分析流程或软件工具要求，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI BioProject 记录，其描述说明 BioProject 是单一研究计划相关生物学数据的集合，并提供多种数据类型的链接入口。关于数据质量评估指标、完整性、准确性或使用限制等具体信息，源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA266547

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA266547

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小气道阻力增加和肺弹性下降是慢性阻塞性肺疾病（COPD）气流受限的重要原因。与肺弹性丧失相对应的病变是肺气肿；小气道阻塞则源于炎症性狭窄和闭塞。尽管它们在生理改变上趋于一致，但不同机制参与了这些过程。基因表达与这些特定表型之间的关系可能比与肺功能的比较更具揭示性。我们测量了43名吸烟者肺组织中肺泡表面积与肺体积之比（SA/V）。对21名受试者的两份样本（其SA/V差异>49 cm²/mL）进行了分析，以筛选表达与SA/V相关的基因。181个转录本的表达水平与SA/V相关（p<0.05）。在其余22名受试者中测试了这些转录本的表达与SA/V之间的关系，作为重复验证。181个基因中有30个仍与SA/V显著相关（P<0.05），且164/181个基因的关联方向一致。

通路和网络分析显示，参与蛋白质泛素化的基因出现富集，蛋白质印迹实验表明，在气道阻塞个体中，参与蛋白质泛素化的基因表达发生了改变。这些数据提示，蛋白质泛素化与降解的改变可能是肺气肿发病机制中的一个重要通路。本研究未提供原始数据。总体设计：将8名GOLD 0受试者（无气道阻塞的吸烟者）的RNA混合，作为参照，与每份个体样本进行比较。使用相同的Agilent芯片设计（平台：GPL3991。Human 3.0 A1，包含23,757个探针组）对标本中的mRNA进行分析，样本来自与GSE8500研究相同的患者队列。由于“批次效应”干扰了结果，我们在开始统计分析之前进行了非常保守的分期/批次校正步骤（

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别