PRJNA206558:miR-223过表达肺上皮细胞系与对照细胞系的差异基因调控

该数据集来自 NCBI,主题为 miR-223 过表达肺上皮细胞系与对照细胞系的差异基因调控,属于呼吸系统疾病分类下的转录组或基因表达数据

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA206558: Differential gene regulation in miR-223 overexpressing pulmonary epithelial cell line compared to control cell line

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA206558:miR-223过表达肺上皮细胞系与对照细胞系的差异基因调控

该数据集来自 NCBI,主题为 miR-223 过表达肺上皮细胞系与对照细胞系的差异基因调控,属于呼吸系统疾病分类下的转录组或基因表达数据。源站描述指出研究聚焦急性肺损伤中 miRNA 介导的中性粒细胞与肺上皮细胞通讯,并涉及含 miRNA 微囊泡作为遗传信息交换方式的评估。数据可用于比较 miR-223 过表达与对照细胞的基因表达差异,支持肺损伤炎症相关调控机制与潜在治疗靶点的探索(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):急性肺损伤(ALI)的特征是在非心源性肺水肿背景下发生急性呼吸衰竭,导致患者出现急性呼吸窘迫综合征(ARDS),并显著增加危重症患者的死亡率。我们研究的主要目标是阐明 miRNA 在肺部炎症过程中中性粒细胞-上皮细胞通讯中的作用,从而确定治疗急性肺损伤(ALI)的新靶点。在我们的研究中,我们发现了 ALI 期间由 miR-223 依赖的中性粒细胞-上皮细胞交互作用。在 ALI 期间,活化的中性粒细胞(PMN)和肺上皮细胞在空间上紧密相邻。并且,由于先前的研究已提示炎症细胞依赖性释放含 miRNA 的微囊泡可能作为从供体细胞向靶细胞交换遗传信息的一种方式,我们评估了 PM

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA206558

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

急性肺损伤(ALI)的特征是在非心源性肺水肿背景下发生急性呼吸衰竭,导致患者出现急性呼吸窘迫综合征(ARDS),并显著增加危重症患者的死亡率。我们研究的主要目标是阐明miRNAs在肺部炎症过程中中性粒细胞-上皮细胞通讯中的作用,从而确定治疗急性肺损伤(ALI)的新靶点。在我们的研究中,我们发现了ALI过程中一种依赖miR-223的中性粒细胞-上皮细胞串扰。在ALI期间,活化的中性粒细胞(PMN)与肺上皮细胞在空间上紧密接触。此外,由于先前的研究已提示炎症细胞依赖性释放含miRNA的微囊泡可能作为从供体细胞向靶细胞交换遗传信息的一种方式,我们在实验性共培养体系中评估了PMN引起的肺上皮细胞miRNA表达改变。

该方法提供了一种选择性且极其稳健的读数:其他miRNA的表达未发生改变或仅中度改变,而肺上皮表达的miR-223在共孵育4或6小时后被显著诱导。进一步的体外和体内研究明确表明,上皮miR-223的增加并非由于miR-223的转录诱导,而是依赖于PMN,并由miR-223从PMN穿梭至肺上皮细胞所致。为探讨miR-223依赖性中性粒细胞-上皮细胞串扰在ALI中的功能作用,我们将小鼠暴露于呼吸机诱导的ALI,观察到ALI期间肺部miR-223的强烈诱导,而在抗体清除PMN后,miR-223的增加被完全消除。此外,对从ALI小鼠分离的肺泡上皮细胞的研究显示miR-223显著增加,表明在体内ALI期间miR-223从PMN穿梭至肺泡上皮。功能研究重

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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